马铃薯miR319基因家族靶基因预测及其功能分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 尹健

作者: 尹健;朱曦鉴;吴瑶瑶;李灿辉;张金喆

作者机构: 云南师范大学云南省马铃薯生物学重点实验室;中国农业科学院农业基因组研究所;中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词: 马铃薯;miR319;靶基因;细胞壁

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2023 年 003 期

页码: 583-595

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过生物信息分析发现,马铃薯miR319基因家族(Stu-miR319)共有3个前体基因,可生成5种成熟序列。序列比对发现,miR319成熟体序列在不同物种间具有高度的保守性,保守位点的分布差异较大。通过构建miR319前体基因的系统演化树发现,Stu-miR319的3个前体基因分属不同分支,且不同物种间的演化关系存在差异。组织特异性表达分析结果表明,Stu-miR319的5种成熟体在叶片中均有高表达。通过构建Stu-miR319前体基因过量表达转基因植株以及转录组测序分析发现,Stu-miR319-5p、Stu-miR319-3p、Stu-miR319a-5p和Stu-miR319b各有4个候选靶基因,Stu-miR319a-3p有2个候选靶基因。通过透射电镜分析发现,在Stu-miR319过量表达的植株中,导管细胞的细胞壁均有降解趋势,说明Stu-miR319基因家族对调控导管细胞细胞壁的完整性具有重要作用。

分类号: S532

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