4种大戟科植物HMGS基因家族的全基因组鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邹智

作者： 邹智;谢贵水;莫业勇;安锋;杨礼富

作者机构：

关键词： 大戟科植物;全基因组;HMGS基因家族

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2014 年 27 卷 06 期

页码： 2259-2266

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A合酶(HMGS)是甲羟戊酸(MVA)代谢途径中的关键酶,催化乙酰-Co A和乙酰乙酰-Co A缩合形成戊二酸单酰辅酶A(HMG-Co A)。研究基于蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树已释放的基因组和EST数据,对这4种大戟科植物的HMGS基因进行了系统鉴定,并在此基础上分析了其基因结构与进化关系。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有1、1、2和2个HMGS基因,所有基因均包含11个内含子。同源分析表明,HMGS广泛存在于各种古细菌、真细菌和真核生物中,显示出较早的起源。在大多基因组已测序的绿色植物中,HMGS主要以单拷贝的形式存在,其中包括团藻、拟南芥、蓖麻和麻疯树,但在木薯和橡胶树中基因出现了加倍现象,这与小立碗藓、水稻和杨树类似。基因表达谱分析显示,在蓖麻的叶片、花、II/III期胚乳、V/VI期胚乳和种子等组织中,Rc HMGS在花和II/III期胚乳中的表达丰度较高,V/VI期胚乳和叶片中次之,种子中最低。

分类号： Q943.2

  • 相关文献

[1]4种大戟科植物PMK基因家族的全基因组鉴定与分析. 邹智,杨礼富,安锋,林位夫,王真辉,袁坤. 2013

[2]大戟科植物MVK基因家族的全基因组鉴定与分析. 邹智,杨礼富,安锋,王真辉,袁坤. 2013

[3]4种大戟科植物Lhca基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析. 邹智,杨礼富,安锋,林位夫. 2014

[4]大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析. 邹智,安锋,杨礼富,王真辉,袁坤. 2013

[5]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013

[6]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009

[7]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017

[8]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010

[9]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[10]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017

[11]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010

[12]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009

[13]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010

[14]口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较. 吕律,杨帆,何继军,靳野,郭建宏,郑海学,刘湘涛. 2014

[15]黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)的全基因组测序和基因组特征研究. 区又君,温久福,李加儿,梁洪海. 2020

[16]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022

[17]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017

[18]木贼镰孢菌D25-1全基因组序列的测定及结构分析. 李雪萍,李建宏,漆永红,郭成,李潇,李敏权. 2019

[19]一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析. 黎少国,张建峰,张春红,沈海燕,刘志成. 2017

[20]苦荞全基因组SSR位点特征分析与分子标记开发. 马名川,刘龙龙,刘璋,周建萍,南成虎,张丽君. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序