浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔婷婷

作者： 乔婷婷;马春雷;周炎花;姚明哲;刘饶;陈亮

作者机构：

关键词： 茶树;遗传多样性;遗传结构;EST-SSR

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 05 期

页码： 744-753

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以茶树品种龙井43幼根为材料,构建cDNA文库并测序,获得4833条EST序列,拼接后得到3482条无冗余EST,总长2290kb。对其进行SSR搜索,共检测到577个SSR位点,分布于500条茶树幼根EST中,其中含有EST-SSR的序列占14.36%,平均每3.97kb出现一个SSR。利用Primer premier5.0,对含有SSR的EST设计引物416对,通过退火温度和多态性筛选,确定可用的引物及其最佳退火温度,并从筛到的引物中选取63对及1对已发表引物作为核心引物,对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示,64对引物均在供试材料中表现出多态性,共检测到232个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型为2～13个,平均4.3个。供试材料多态性信息量(PIC)介于0.02～0.84,平均0.44;扩增位点的观测杂合度平均为0.44,期望杂合度平均为0.48。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种(系)。不同地方资源群体多态性信息量为0.24～0.36,举岩群体的多样性最高,惠明群体的多样性最低。浙江各地区以杭州资源的多态性最高,PIC达0.41;丽水的多态性最低,PIC为0.24。Structure2.2群体结构分析和UPGMA聚类分析表明,地方品种、选育品种(系)具有相对独立的群体结构,选育品种(系)根据亲缘关系的不同形成不同的类群。

分类号： S571.1

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