马铃薯花青素转录激活基因stwd40的克隆与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 罗遵喜
作者: 罗遵喜;刘仕芸;张树珍;杨本鹏;蔡文伟
作者机构:
关键词: 马铃薯;花青素转录激活基因;克隆;RT-PCR
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2008 年 35 卷 09 期
页码: 1317-1322
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据GenBank中报道的茄属植物矮牵牛花青素wd40类转录激活基因an11及番茄wd40基因113964R的mRNA序列的保守区结构,设计简并引物,从紫色马铃薯皮中克隆了马铃薯wd40类转录激活基因的保守片段,再利用RACE技术分别获得了该基因的3′端和5′端。序列分析表明,该基因核苷酸序列为1292bp,具有完整的编码框,推导其编码362个氨基酸,命名为stwd40。推测的氨基酸序列与GenBank数据库中大量物种的花青素转录激活蛋白wd40有较高的同源性,其中与矮牵牛花青素转录调控基因an11的相似性达86%。RT-PCR表达分析显示stwd40在紫色马铃薯叶、茎、皮、肉及根中都有表达,其中在茎中的表达量最高,肉中表达量最低;其在白色马铃薯的叶、皮和肉中也有表达,推测该基因为组成型表达。
分类号: S532
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