南方根结线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及其特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张玉

作者： 张玉;茆振川;陈国华;冯东昕;谢丙炎

作者机构：

关键词： 南方根结线虫;fosmid文库;伴生细菌;互作关系;多样性

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2009 年 36 卷 06 期

页码： 545-549

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究南方根结线虫与伴生细菌的互作及其伴生细菌多样性,采用碘海醇介质离心技术、SDS裂解法和酚/氯仿抽提法等构建了南方根结线虫Meloidogyne incognita伴生细菌宏基因组fos-mid文库,并进行文库特征分析。结果表明,该文库包含3万个克隆,插入片段大小分布在30~45kb之间,平均长度为40kb左右;共计包含1171Mb DNA;质粒在fosmid传代中稳定遗传,没有发现插入片段的丢失或重排。末端测序结果显示,文库中南方根结线虫序列占2.04%,细菌序列占44.90%,无同源序列占53.06%;南方根结线虫伴生细菌优势种群为Sphingopyxis属和代尔夫特菌属Delftia。

分类号： S432.45

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