半滑舌鳎有效群体大小估计

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王伟峰

作者： 王伟峰;崔瑜;蒋丽;王悦玲;王焕岭;李恒德

作者机构：

关键词： 半滑舌鳎;简化基因组测序(2b-RAD);连锁不平衡;有效群体大小

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 997-1004

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解半滑舌鳎当前的群体遗传结构,探究半滑舌鳎有效群体大小(Ne)发展趋势及现状,实验通过性别特异性分子标记随机鉴定了800尾半滑舌鳎的遗传性别,选取297个遗传雌性半滑舌鳎样本进行简化基因组测序(2b-RAD),获得了64 416个可用SNP标记,利用这些标记进行全基因组范围的连锁不平衡分析得到各染色体上连锁不平衡分布;根据标记间不同物理间距进行半滑舌鳎有效群体大小的估计,初步了解各历史世代下有效群体规模;通过选择0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0、10.0 Mb等7个不同染色体片段大小反映出半滑舌鳎群体遗传结构经过自然与人工共同选择的历史发展趋势。结果显示,半滑舌鳎有效群体大小随其连锁不平衡程度衰减而呈连续下降趋势,至2世代前其有效群体大小仅为29尾左右。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]林木植物的全基因组选择. 田郎. 2015

[2]小麦taf1位点的连锁不平衡分析. 朱晓滨,窦秉德,侯北伟,徐海风,杨晋彬,刘福霞,顾正中. 2009

[3]单核苷酸多态性在作物遗传及改良中的应用. 杜春芳,刘惠民,李润植,李朋波,任志强. 2003

[4]小麦雌性育性与SSR分子标记的关联分析. 窦秉德,朱晓滨,张新玲,徐海明,侯北伟,徐海风,杨晋彬,高爱农. 2009

[5]绵羊微卫星3DDU和FecB基因的多态及连锁分析. 张宝云,储明星,王凭青,方丽,狄冉. 2009

[6]山西谷子核心资源群体结构及主要农艺性状关联分析. 王海岗,温琪汾,穆志新,乔治军. 2019

[7]海南短日照条件下谷子穗部性状的全基因组关联分析. 贾小平,张博,董志平,全建章,王永芳,张小梅,袁玺垒,李剑峰,戴凌峰. 2018

[8]关联分析在植物种质资源研究中的应用. 王秀全,何丹,庞启华,税红霞,卢庭启,蒋晓芳. 2014

[9]陆地棉种质资源群体结构与抗旱、耐盐性状的关联分析. 孙君灵,潘兆娥,何守朴,王立如,庞保印,杜雄明. 2013

[10]绵羊心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性分析. 谢秀兰,梁小军,马青,马小明,马丽娜,岳彩娟,杨炜迪,额尔和花. 2018

[11]猪十二号染色体上多个SNP与经济性状的关联分析. 杨述林,王恒,任红艳,李奎. 2006

[12]东北春大豆花荚脱落性状与SSR标记的关联分析. 王欢. 2014

[13]小尾寒羊微卫星座位LSCV043与FecB基因的连锁分析. 张林,李春苗,储明星,陈宏权,李学伟,方丽,狄冉,马月辉,李奎. 2009

[14]绵羊微卫星OarJL36和FecB基因的多态及连锁分析. 储明星,张宝云,王凭青,方丽,狄冉,马月辉,李奎. 2009

[15]引进陆地棉种质材料的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡. 杨洋,马君,李波,胡文冉,王玉晶. 2015

[16]绵羊全基因组连锁不平衡分析. 王光凯,朱才业,樊红樱,张莉,魏彩虹,赵福平,杜立新. 2014

[17]绵羊微卫星471U和FecB基因多态与连锁分析. 狄冉,张宝云,储明星,王凭青,方丽. 2009

[18]小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR 分析. 白鹏,程须珍,王丽侠,王素华,陈红霖. 2014

[19]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用. 王荣焕,王天宇,黎裕. 2007

[20]鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析. 闵霞,贾智英,李池陶,李飞,石连玉. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序