草鱼载脂蛋白A-Ⅰ-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘小献

作者： 刘小献;白俊杰;于凌云;李胜杰

作者机构：

关键词： 草鱼;SNP;载脂蛋白A-Ⅰ;apoA-Ⅰ-1;生长性状;双倍型;关联分析

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN： 1000-9957

年卷期： 2012 年 27 卷 001 期

页码： 12-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR产物直接测序法和PCR-RFLP法对草鱼EST文库中载脂蛋白A-Ⅰ-1基因(Apoprotein A-Ⅰ-1,apoA-Ⅰ-1)3'非编码区进行SNPs筛选,在珠江水系草鱼Ctenopharyngodon idella养殖群体144个样本中发现2个SNPs位点.C792T位点的CC型占46.53%,CT型占50.69%,TT型占2.78%;G851A位点的GG型占77.08%,GA型占20.83%,AA型占2.08%.采用一般线性模型对2个SNPS位点与草鱼4个生长性状-体质量、体长、体高和头长进行关联分析,结果表明:C792T位点TT型个体的体质量、体长、体高和头长均值高于CT型和CC型个体的生长性状指标值,但未达到显著水平(P>0.05);G851A位点GG型个体的体质量、体长、体高和头长均值高于GA型和AA型个体的生长性状指标值,且GG型个体的体长和头长均值与GA型和AA型个体均存在显著差异(P<0.05).将2个SNPs位点不同基因型组合成6种双倍型,关联分析结果表明,双倍型D3(TTC792T - GGG851A)个体的体质量均值最高,D6型(CCC792T-AAG851A)个体的体质量均值最低,且二者在体长、体高、头长均值间存在显著差异(P<0.05).推测C792T位点TT型为有利基因型;G851A位点GG型为有利基因型,AA型为不利基因型.本研究结果为草鱼分子辅助育种提供了候选标记,为加快草鱼育种进程奠定了基础.

分类号： Q789

  • 相关文献

[1]草鱼载脂蛋白A-I-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析. 刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰. 2012

[2]尼罗罗非鱼MYF6基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析. 高风英,佟延南,刘志刚,曹建萌,王淼,衣萌萌,可小丽,卢迈新,朱海. 2024

[3]草鱼羧肽酶A4基因部分序列多态性及生长性状关联分析. 曹婷婷,刘小献,白俊杰,于凌云. 2012

[4]草鱼EST-SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析. 王解香,白俊杰,于凌云. 2012

[5]斑点叉尾MSTN基因4个SNP位点及其与生长性状的相关性. 张世勇,王明华,钟立强,秦钦,潘建林,陈校辉,边文冀. 2017

[6]斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析. 张世勇,钟立强,秦钦,王明华,潘建林. 2016

[7]三疣梭子蟹生长相关SNP位点的鉴定. 张德宁,吕建建,刘萍,冯艳艳,高保全,李健. 2015

[8]草鱼醛缩酶B基因部分序列的SNP多态性及其与生长性状的关联分析. 曹婷婷,白俊杰,于凌云,樊佳佳. 2012

[9]尼罗罗非鱼MYF5基因SNP位点筛选及其与不同群体生长性状的关联分析. 佟延南,高风英,刘志刚,王淼,曹建萌,衣萌萌,可小丽,卢迈新,朱海. 2023

[10]大口黑鲈肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性位点的筛选及其与生长性状关联性分析. 于凌云,白俊杰,樊佳佳,李小慧,叶星. 2010

[11]草鱼PKMa基因SNPs筛选及与耐糖性状的关联分析. 樊佳佳,唐小红,白俊杰,姜鹏,马冬梅,李胜杰. 2019

[12]草鱼幼鱼生长性状和肌肉成分的遗传参数估计. 傅建军,张猛,沈玉帮,徐晓雁,孙俊龙,李家乐. 2015

[13]草鱼PRL基因多态性与幼鱼生长性状和肌肉成分的关联分析. 傅建军,张猛,沈玉帮,陈勇,徐晓雁,李家乐. 2016

[14]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[15]草鱼生长性状的遗传参数和育种值估计. 姜鹏,韩林强,白俊杰,樊佳佳,陈柏湘,胡重江,周春龙,李胜杰. 2018

[16]草鱼MyoD基因SNP和Indel标记的筛选及其与生长性状的关联分析. 陈静,何吉祥,樊佳佳,黄龙,吴本丽,宋光同,汪翔,武松. 2018

[17]草鱼柠檬酸合酶基因SNP筛选及与生长性状的关联分析. 樊佳佳,刘小献,白俊杰,于凌云. 2014

[18]不同地理来源草鱼群体杂交后代的生长性能分析（英文）. 樊佳佳,陈柏湘,白俊杰,姜鹏,韩林强,于凌云. 2016

[19]不同地理来源草鱼群体杂交后代的生长性能分析. 樊佳佳,陈柏湘,白俊杰,姜鹏,韩林强,于凌云. 2015

[20]DHRS4基因在猪骨骼肌中的表达及其与生长性状的关联分析. 张垒霞,杨言昭,李文通,刘颖,周荣,杨亚岚,李奎. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序