草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张馨宇

作者： 张馨宇;戚华彩;董向向;李贺;张志宏

作者机构： 辽宁省农业科学院;沈阳农业大学

关键词： 草莓;miRNA;前体;靶基因;功能分析

期刊名称： 沈阳农业大学学报

ISSN： 1000-1700

年卷期： 2016 年 47 卷 02 期

页码： 141-147

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： micro RNA(miRNA)是来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,在转录后水平上负调控基因表达,在植物的生长发育和胁迫应答等方面起重要作用。以栽培草莓艳丽为试材,利用RT-PCR技术克隆草莓叶片中5种新miRNA的前体及靶基因,分析靶基因的结构特征与功能,结果表明:草莓mi R-6,mi R-12,mi R-13,mi R-14,mi R-29的前体长度分别为513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的茎环结构,其中mi R-12、mi R-13的成熟miRNA序列在茎环3'端臂上,mi R-6、mi R-14、mi R-29成熟miRNA序列在茎环的5'端臂上。mi R-14与mi R-29的靶基因分别为854bp和690bp,与森林草莓基因组对应序列一致性为98.72%和99.42%,其中mi R-29靶基因是GRP基因,编码143个氨基酸,推测mi R-29靶基因在草莓植株的胁迫响应中有重要调控作用。本研究丰富了草莓miRNA的研究,为揭示草莓miRNA的生物学功能奠定基础。

分类号： S668.4

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