河南省猪瘟流行毒的E_2基因序列分析和基因分型

文献类型: 中文期刊

第一作者: 薛青红

作者: 薛青红;刘湘涛;杜守山;张永国;韩雪清;张彦明;何学斌;庄淑珍;谢庆阁

作者机构:

关键词: 猪瘟病毒;E2基因;糖蛋白;序列分析

期刊名称: 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN: 1000-2782

年卷期: 2002 年 30 卷 02 期

页码: 37-42

收录情况: 北大核心

摘要: 采用 RT- PCR和 n PCR扩增出 3株河南省近期 (1999~ 2 0 0 0年 )猪瘟流行野毒的 E2 基因 ,分别克隆于 PMD- 18T载体 ,对其进行了核苷酸序列测定及氨基酸序列推导 ,同时进行了同源性比较及 E2 糖蛋白结构的分析。结果表明 ,所测 3株 HCV E2 基因的长度均为 116 9bp。编码的氨基酸序列均包括完整信号肽序列和部分跨膜序列 ,共由 384个氨基酸组成。3株流行毒的 E2 基因核苷酸序列同源性在 99%以上 ,相应的氨基酸序列同源性也在 99%以上 ;这 3株流行毒与 C-株兔脾组织毒 (疫苗种毒 ) E2 基因的核苷酸序列同源性在 83.14 %~ 83.2 3% ,相应的氨基酸序列同源性在 88.14 %~ 88.6 8%。经遗传发生关系分析 ,C-株兔组织毒 C-株细胞毒属于组群 1(group 1) ,河南省近期流行猪瘟毒属于组群 2 (group 2 ) ,近期猪瘟流行毒与 C-株疫苗毒的 gp5 5蛋白之间存在一定的差异

分类号: S852.651

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