我国部分地区沙地葡萄茎痘相关病毒分离物外壳蛋白序列变异分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 朱红娟

作者: 朱红娟;胡国君;范旭东;张尊平;任芳;董雅凤

作者机构:

关键词: 沙地葡萄茎痘相关病毒;RT-PCR检测;序列分析

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2014 年 41 卷 02 期

页码: 169-175

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确我国葡萄中沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)的感染情况及病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的变异特点,从而为其致病性、病害的防治以及抗病毒基因工程等研究提供依据,本研究对采自我国16个省市自治区的65个葡萄品种305株葡萄样品中的GRSPaV进行RT-PCR检测,根据地区与品种差异选取了24个阳性样品进行cp基因克隆与测序分析,并对不同RNA提取方法进行了比较。结果显示,114株样品被GRSPaV侵染,平均带毒株率为37.4%;分离物间及同一分离物不同克隆间的序列差异较大,从24个分离物克隆获得的37条cp基因序列与来源于不同国家的12个GRSPaV分离物的核苷酸序列同源性为80.5%~99.7%,氨基酸序列同源性为88.8%~100%;各个分离物的遗传距离无明显地域差异;SiO2吸附法比SDS法和CTAB法更适宜葡萄样品RNA的提取。

分类号: S436.631.1

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