玉米钙依赖蛋白激酶38(ZmCDPK38)的生物信息学及表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李建平

作者： 李建平;足木热木·吐尔逊;常晓春;郝晓燕;陈果;高升旗;孙良斌;黄全生

作者机构：

关键词： 玉米;ZmCDPK38;非生物胁迫;生物信息;基因表达

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 49-55

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究ZmCDPK38与其它物种中同源基因之间的遗传进化关系,通过与亲缘关系较近且功能已知的同源基因比较,对ZmCDPK38的功能进行理论预判。确定ZmCDPK38基因在不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。【方法】生物信息学分析使用在线分析工具及MEGAX软件;基因表达分析采用Real-time PCR。【结果】ZmCDPK38与ZmCDPK28及高粱等6个其它植物物种的CDPK的氨基酸序列具有较高的一致性,遗传进化关系上较近。氨基酸序列包含4个结构域,具有CDPKs家族氨基酸的典型特征,Ser/Thr蛋白激酶结构域相对保守。ZmCDPK38基因在叶片中的表达量最高,其次是茎部、根、雄穗及雌穗;受盐胁迫及干旱胁迫诱导,ZmCDPK38基因的表达水平显著上升,在低温和高温胁迫条件下基因表达未见明显变化。【结论】ZmCDPK38基因作为CDPK家族成员,在蛋白序列和结构上具备典型的CDPK家族成员特征;ZmCDPK38基因响应干旱胁迫与盐胁迫,可能在干旱应答与盐胁迫应答反应中发挥一定的功能。

分类号： S513

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