正常发育与发育阻遏雌虫差异表达miRNA分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩愉

作者： 韩愉;乔洪宾;冯金涛;刘金明;李浩;陆珂;金亚美

作者机构：

关键词： 差异表达;测序技术;个体发育过程;细胞组分;细胞周期;生物信息学;混合感染;细胞粘附;统计分析;丰度

期刊名称：

ISSN：

年卷期： 2015 年

页码： 2

收录情况： CSCD

摘要： 血吸虫正常发育雌虫(混合感染雌虫)和发育阻遏雌虫(单性感染雌虫)存在显著的差异;miRNA是对生命活动具有调控作用的一类重要的功能分析。为进一步探索miRNA与雌虫发育阻遏的关系,通过HiSeq高通量测序技术,对感染后25天的正常发育雌虫和发育阻遏雌虫的小RNA进行深度测序,分析不同状态的雌虫miRNA表达情况,并通过Real-timePCR对找出的差异表达miRNA进行验证。通过对获得的原始Reads处理,正常发育雌虫和发育阻遏雌虫分别获得9358376和9314275高质量reads,均占总获得resds的95%以上。与基因组进行比对统计分析,获得序列55%左右比对上基因组。通过生物信息...

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