多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘晓妹
作者: 刘晓妹;蒲金基;张欣;漆艳香;谢艺贤;张贺;郑服丛
作者机构:
关键词: 多主棒孢菌;蛋白激酶;克隆;生物学信息
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2012 年 0 卷 10 期
页码: 168-172
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA。生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI)6.43。从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域。推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等。
分类号: S432.4
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