基于SSR的西南地区野生菰资源遗传多样性及遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 黄雪雯

作者: 黄雪雯;王惠梅;苏晓娜;王圣子海;熊琦哲;江绍琳;吴建利;江绍玫

作者机构:

关键词: 野生菰;SSR标记;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 江西农业大学学报

ISSN: 1000-2286

年卷期: 2017 年 39 卷 02 期

页码: 409-418

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 菰属(Zizania latifolia(Griseb.)Trucz.)为禾本科水稻近缘属之一,携带水稻育种所需的多种优良性状基因。采用本项目前期筛选出来的19对水稻SSR标记,对我国西南地区4省市25个野生菰居群进行了遗传多样性及遗传结构分析。POPGEN32软件分析显示,19对SSR标记扩增谱带的多态性条带百分比为100%;在物种水平上,西南地区野生菰等位基因数和有效等位基因数分别为2和1.608,Nei’s基因多样性指数和Shannon’s多样性信息指数分别为0.349和0.517;25个野生菰居群间的遗传相似性系数为0.603 6~0.937 2,遗传距离介于0.064 8~0.504 8。NTsys2.10e聚类分析结果显示,阈值在0.196时,25个居群聚被分成10组;阈值为0.238时,第Ⅰ组可再聚分为4个亚组。居群间平均基因流为Nm=0.788。AMOVA分析结果显示,西南地区野生菰88.87%的变异存在于居群内部,11.13%的变异存在于居群间。研究结果表明,西南地区野生菰资源有着丰富的遗传多样性,遗传漂变在西南地区野生菰植物的遗传分化中起到了一定的作用,各居群的聚类结果与地理分布无明显相关性。推测选择压力可能在西南地区野生菰遗传分化中起着重要作用。研究结果有助于加深对我国西南地区乃至更大范围内野生菰资源遗传进化的认识,同时为野生菰种质资源保护提供理论依据。

分类号: S511.9`Q943

  • 相关文献

[1]利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构. 苏晓娜,王惠梅,黄雪雯,谢小燕,张孝天,牛恋,董琳,江绍琳,吴建利,江绍玫. 2018

[2]大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析. 王晋,王世红,赖勇,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 2014

[3]180份玉米自交系亲缘关系的分子评价. 乔治军,刘龙龙,南晓洁,赵秀娟,王海岗. 2011

[4]“十五”大豆创新种质和1963—1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007

[5]四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析. 王玲,左示敏,张亚芳,陈宗祥,潘学彪,黄世文. 2015

[6]"十五"大豆创新种质和1963-1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007

[7]基于SSR标记的山西高粱地方品种遗传多样性和遗传结构分析. 李萌,秦慧彬,王宇楠,闫建俊,穆志新. 2020

[8]基于SSR标记的西南地区野生带叶兜兰资源遗传多样性分析. 徐言,陈之光,徐玉凤,葛红,杨树华,赵鑫,寇亚平,于晓南,贾瑞冬. 2023

[9]云南粳稻遗传多样性及群体结构分析. 管俊娇,杨晓洪,张建华,王江民,张鹏,李彦刚. 2018

[10]基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析. 谢小燕,苏晓娜,王惠梅,江绍琳,吴建利,江绍玫. 2019

[11]玉米耐盐种质筛选及群体遗传结构分析. 郝德荣,程玉静,徐辰武,冒宇翔,彭长俊,薛林. 2013

[12]利用微卫星标记分析山西糜子的遗传多样性. 王舒婷,何杰丽,石甜甜,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2019

[13]云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析. 刘树芳,张先闻,董丽英,刘沛,田维逵,周伍民,杨勤忠. 2023

[14]四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析. 张瑜,鄢家俊,白史且,彭燕,梁绪振,张建波,张劲,胡超. 2015

[15]仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 潘传燕,臧云鹏,廖梅杰,王印庚,荣小军,张正,李彬,陈贵平. 2012

[16]利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构. 唐继高,朱丽莉,李洪曙,王清颖,韩雁雁. 2015

[17]利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构. 吴静,张研,霍堂斌,孙效文. 2013

[18]增殖放流对日本囊对虾群体遗传多样性的影响评估. 魏鸿擎,张凤英,蒋科技,姜亚洲,孟永永,宋炜,马春艳,程家骅,马凌波. 2016

[19]长蛸Octopus variabilis自然群体生化遗传学研究. 高强,郑小东,孔令锋,王昭萍,王如才. 2009

[20]陕西省异色瓢虫种群遗传结构及其多样性. 张小飞,徐玲玲,刘津,白明皓,王振营. 2018

作者其他论文 更多>>