梨ERF超家族全基因组鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 钟必凤
作者: 邓家林;李文贵;张全军
作者机构:
关键词: 梨;乙烯响应因子;二次花;基因家族
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2019 年 012 期
页码: 3874-3886
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 中国南方地区普遍存在的由于干旱等原因提早落叶导致的梨二次花现象给生产带来了很大的损失,且该过程可以通过人工摘叶处理进行模拟诱导.乙烯响应因子ERF成员被认为参与了植物的激素应答、生物和非生物胁迫以及生长发育调控过程.本研究基于公开的白梨基因组序列,利用生物信息学方法对其中的ERF因子进行鉴定,并对其分组及各组结构域进行了详细分析.结合课题组采用摘叶诱导二次花形成过程中的梨转录组数据,分析了响应该过程的ERF成员.结果表明,共获得了211个白梨ERF家族编码基因,并可根据系统进化关系和结构域保守性分为11个组,其中种特有组一个.砂梨摘叶诱导二次花过程的转录组数据分析表明,有37个ERF因子差异表达,摘叶初期(摘叶后7 d)无响应,中期(摘叶后17 d)以下调表达为主,后期上调.对其中的4个差异表达基因进行了实时荧光定量PCR分析验证,结果与转录组分析结果吻合.此研究进一步丰富了梨响应胁迫反应的ERF基因资源,为进一步探讨ERF在成花过程中的作用提供了理论依据.
分类号: S661.2
- 相关文献
[1]白梨SPL转录因子在二次成花诱导中的响应. 钟必凤,邓家林,李文贵,张全军,刘冬梅,曲么日布. 2020
[2]基于高通量测序的梨果实常用内参基因表达稳定性分析. 王月志,戴美松,蔡丹英,施泽彬. 2019
[3]南方砂梨二次花分级标准探讨. 钟必凤,李文贵,邓家林,张绍铃. 2013
[4]‘丰水’梨二次开花过程中枝皮和花芽有机营养变化特征. 钟必凤,李文贵,邓家林,张绍铃. 2016
[5]对台农1号芒摘早花延迟花期的实践与思考. 覃贤宁,黄国弟,鄂权,李日旺,黄耀,罗世杏,覃昱茗. 2021
[6]利用RNA-seq技术分析淹水胁迫下转BnERF拟南芥差异表达基因. 吕艳艳,付三雄,陈松,张唯,戚存扣. 2015
[7]香蕉MaERF-1基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 金志强,徐碧玉,黄东梅,胡伟,李凯,许奕. 2017
[8]苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析. 张俊,蔡苏云,徐子豪,侯蕾,贺润丽,尹桂芳,王莉花,王艳青,卢文洁,孙道旺. 2024
[9]小麦乙烯转录因子TaERF2响应湿害胁迫的表达分析. 宋桂成,周淼平,余桂红,姚金保,马鸿翔. 2022
[10]玉米ZmEREB46基因调控耐渍性功能探究. 唐开媛,梁昆,张彦军,王兴荣,邱法展. 2024
[11]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[12]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[13]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[14]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008
[15]拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析. 王凯. 2010
[16]蝴蝶兰NBS-LRR家族基因挖掘和生物信息学分析. 蒋卉,张晶,符真珠,董晓宇,王慧娟,李艳敏,高杰,王利民,张和臣. 2018
[17]陆地棉蔗糖磷酸合成酶基因家族的鉴定及表达分析. 晁毛妮,胡海燕,付丽娜,温青玉,胡根海,骆雨锋,李娅楠,王清连. 2020
[18]普通烟草PMEI家族的鉴定与表达分析. 韩林贺,丁安明,孔英珍. 2018
[19]植物β-半乳糖苷酶研究进展. 李军玲,闫双勇,张融雪,王晓静,孙玥,苏京平,孙林静. 2020
[20]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011
作者其他论文 更多>>
-
四川省梨产业发展概况
作者:李文贵;钟必凤;林杨;蒋林珈;田云;邓家林;张全军
关键词:四川省;梨产业;发展现状
-
四川盆地梨园鸟害发生特点和综合防控措施
作者:蒋林珈;李吉;董宇亮;杨兴俊;张靖;李文贵;钟必凤;张全军
关键词:四川梨园;鸟害;防治措施;和谐共生
-
砂梨二次开花的影响因素及综合防控技术
作者:张全军;李文贵;林杨;钟必凤;蒋林珈;邓家林
关键词:砂梨;二次开花;影响因素;综合防控技术
-
套袋对石榴果实品质、产量及农药残留的影响
作者:蒋林珈;钟必凤;钟敏;李文贵;田云;张全军
关键词:石榴;套袋;果实品质;农药和重金属残留
-
四川省梨产业发展存在的问题及对策建议
作者:张全军;钟必凤;林杨;李文贵;蒋林珈;邓家林
关键词:梨产业;四川省;发展趋势;对策建议
-
翠冠梨柱状栽培技术
作者:吴志广;邓家林;张全军;王杰;梁科;郭勇
关键词:翠冠梨;柱状栽培;技术
-
青脆李成熟期裂果主要原因及防治措施
作者:刘佳;邓家林;田云;张国薇
关键词:青脆李;裂果;原因;防治措施
