紫花苜蓿几丁质酶C1ass I基因cDNA全长克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 伊亚莉

作者： 伊亚莉;关宁;张文娟;王涌鑫;苗丽宏;李聪

作者机构：

关键词： 紫花苜蓿;几丁质酶基因;cDNA克隆;序列分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2011 年 39 卷 2 期

页码： 29-34

收录情况： CSCD

摘要： 依据NCBI中已登录的截形苜蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段ESI’序列(GenBank登录号:AFl67323)设计引物，以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)为试验材料，利用RACE技术进行cDNA全长克隆。利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132 bp，其中含有1个930 bp的开放阅读框，编码309个氨基酸。分子质量为33.538 ku，等电点pI为5.258，是一个酸性蛋白且分泌到胞外。将该基因命名为MsChi J(GenBank登录号为HM224449)。聚类分析显示:它与其他已知植物Class I类几丁质酶基因具有高度的同源性；结构分析表明:该蛋白的二级结构中仅螺旋、延伸链、B转角和无规则卷曲分别占25.89％、10.68％、4.21％、59.22％；功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白，属于几丁质酶第19家族。

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