野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘慧珍

作者： 刘慧珍;姚秋成;高玉伟;葛叶

作者机构：

关键词： H9N2亚型禽流感病毒;circRNA;miRNA;mRNA;ceRNA调控网络

期刊名称： 中国病原生物学杂志

ISSN： 1673-5234

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 630-636

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 禽流感是由禽流感病毒（AIV）引起的一种从轻微呼吸道症状到急性、败血性传染病综合征。非编码RNA在禽流感病毒复制中的联合作用尚不清楚，尤其是circRNA表达谱及其对AIV感染发病机理的影响尚有很多空白。本研究旨在明确野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制。方法 利用RNA高通量测序和生物信息学方法分析野鸟源H9N2亚型AIV感染小鼠后其肺脏组织circRNAs水平的变化，并以circRNA为ceRNA调节靶标构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果 通过系统分析AIV感染小鼠肺脏中的circRNA及miRNA和mRNA表达谱，共鉴定到5 335个不同的circRNAs,并分别筛选到654、85和1 387个差异表达的circRNA、 miRNAs和mRNAs。基于基因本体（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析表明，差异表达circRNAs的宿主基因主要参与先天免疫反应，细胞生长和死亡、信号转导、免疫系统、免疫疾病。此外，对circRNA-miRNA-mRNA调控网络的整体分析显示，在H9N2亚型AIV感染中存在许多circRNA-miRNA-mRNA相互作用，其中筛选出的144个过表达circRNA可能存在通过吸附miR-185-5p和miR-34c-5p使其表达下调，从而使下游的功能基因表达上调，诱导宿主细胞钙离子信号通路，进而促进H9N2病毒感染的潜在发病机制。结论 通过鉴定circRNA的表达谱和构建circRNA相关的调控网络，揭示了一个丰富的circRNAs和ceRNA网络参与H9N2病毒感染的调控，为H9N2病毒与宿主的相互作用及发病机制提供了新的见解。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]植物非编码RNA及其在甜菜中的应用研究. 李任任,吕春华,於丽华,耿贵. 2019

[2]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024

[3]circ-13267通过let-7-19/ERBB4通路调控蛋鸭卵泡颗粒细胞凋亡. 吴艳,张昊,梁振华,潘爱銮,申杰,蒲跃进,黄涛,皮劲松,杜金平. 2022

[4]非编码RNA调控畜禽肌内脂肪沉积的研究进展. 齐婧,谭娅,王婧,张静,赵春萍,张正群,史开志. 2022

[5]基于转录组学筛选与哺乳动物睾丸发育相关基因及调控网络的研究进展. 孙武,罗静,李发弟,李万宏,乐祥鹏. 2018

[6]苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建. 张小伟,何军敏,徐新明,田月珍,关鸣轩,张漫,付雪峰,哈尼克孜?吐拉甫,黄锡霞,田可川. 2022

[7]RNA分子在植物韧皮部长距离运输的研究进展. 李苹芳,羊杏平,徐锦华,刘广,姚协丰,高长洲,朱凌丽. 2013

[8]基于全转录组测序的绵羊胚胎不同发育阶段骨骼肌circRNA的分析与鉴定. 石田培,王欣悦,侯浩宾,赵志达,尚明玉,张莉. 2020

[9]山羊环状RNA circ_ZCCHC24的鉴定和表达分析. 陶虎,何雷,熊琪,张年,刘洋,陈明新. 2019

[10]circRNA研究及其在医学中的应用. 杨玉莹,王成坦,高蕊,甘尚权. 2019

[11]基于跨反向剪接位点引物特异性检测circRNA的PCR方法. 孙宝箴,全龙萍,康慧,姚玉新,沈甜,陈卫平,杜远鹏,高振. 2022

[12]高通量测序分析褐飞虱circRNA表达谱及其潜在功能. 于鑫滢,赵哲奇,闸雯俊. 2024

[13]植物环状RNA研究进展. 高振,骆萌,王磊,宋士任,赵丽萍,许文平,张才喜,王世平,马超. 2019

[14]西藏牛与三江牛心脏组织低氧适应相关circRNA分析. 白佳灵,王会,钟金城,陈智华,柴志欣,王吉坤,王嘉博,武志娟,信金伟. 2021

[15]大白猪和莱芜猪肌内脂肪组织circRNAs的鉴定与分析. 李嫒,张秀秀,黄万龙,解领丽,苗向阳. 2018

[16]H9N2亚型禽流感病毒华东分离株的生物学特性及遗传进化分析. 刘慧谋,吴培培,吴双. 2009

[17]H9N2亚型禽流感病毒对鸡的免疫抑制机制. 刘青涛,李银,刘娜,杨婧,韩凯凯,刘宇卓,赵冬敏,黄欣梅,田宇杰. 2018

[18]太子参须提取物对鸭流感病毒体外试验初探. 张炎达,施少华,潘慧青,杨荣平,赵齐. 2021

[19]HgN2亚型禽流感病毒的序列分析及对哺乳动物致病力研究. 王金良,李旭勇,范俊,郭晶,邓国华,施建忠,陈化兰. 2013

[20]H9N2亚型禽流感病毒冷适应株的培育及SPF鸡胚感染后的免疫应答分析. 马鑫鑫,崔宁,历成海,黄庆华,梁立生,杨少华,赵孝民,许传田. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序