瓜类果斑病菌致病基因及靶标基因的预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 严婉荣

作者： 王铁霖;戴良英;杨玉文;王建玉;赵廷昌

作者机构：

关键词： 瓜类果斑病菌;致病基因;靶标基因

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2012 年 38 卷 05 期

页码： 100-104

收录情况： 北大核心

摘要： 哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、劳尔氏菌属、土壤杆菌属、木质部小菌属中的致病基因和参考文献中已报道的致病基因,下载相关致病基因的氨基酸序列,与瓜类果斑病菌的全氨基酸序列进行localblast,取E<10-5的为候选基因,得到果斑病菌中与致病性相关的基因,并对未知蛋白进行产物预测。同时,根据已经公布的靶标基因,用同样的比对方法,得到果斑病菌中潜在的靶标基因。本研究通过保守估计,得到77个致病性相关蛋白,预测了其中7个未知蛋白的产物,得到46个靶标蛋白。致病基因和靶标基因的分析预测,对以后研究此类基因提供了指导作用,为更好地防治该病害提供了理论基础。

分类号： S436.5

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