哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨晓燕

作者： 李梅;张林;庞莉;孙青;蒋细良

作者机构：

关键词： 哈茨木霉;厚垣孢子;转录组测序;差异表达基因

期刊名称： 中国生物防治学报

ISSN： 2095-039X

年卷期： 2015 年 31 卷 01 期

页码： 85-95

收录情况： 北大核心

摘要： 应用高通量转录组测序技术对哈茨木霉产厚垣孢子前期和中期两个不同转录本进行测序,获得12186个unigenes,平均长度为1483 bp。被注释到GO(gene ontology)数据库的unigenes有6042个。通过与KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database)数据库比对,有5151个unigenes被注释到239条KEGG代谢途径中。比较两个样本,共有差异表达基因(DEG)6329个,包括3602个上调基因,2727个下调基因。其中几丁质酶基因16个,13个上调、3个下调;几丁质合成酶基因4个,均上调;葡聚糖酶基因21个,11个上调、10个下调。KEGG富集分析显示,氨基糖和核苷酸的糖代谢途径涉及的差异表达基因最多,有23个;其次是淀粉和糖代谢途径,有14个差异表达基因参与。推测这两条代谢途径以及相关的差异表达基因可能与厚垣孢子形成有关。本研究为深入研究哈茨木霉Th-33厚垣孢子的形成机制奠定了基础。

分类号： S476.1

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