基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔小燕

作者： 乔小燕;乔婷婷;周炎花;金基强;马春雷;姚明哲;陈亮

作者机构：

关键词： 茶树;白毛茶;遗传多样性;遗传结构;遗传分化

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 16 期

页码： 3297-3311

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过揭示茶树资源遗传多样性、遗传结构和遗传分化关系,为资源的有效保护和充分利用提供理论依据。【方法】利用109对核心EST-SSR标记对广东、广西的105份茶树核心资源进行遗传多样性和遗传分化比较分析;同时对广东和广西资源组群间、组群内白毛茶和茶种群间、种群内进行AMOVA分子方差分析,进一步剖析遗传结构,并绘制群体遗传结构图。【结果】109对核心EST-SSR标记共检测到435个等位基因,平均等位基因(NA)3.99个,平均有效等位基因(NE)为2.12,平均Nei's基因多样性(H)为0.59,平均观测杂合度(Ho)为0.32,平均期望杂合度(He)为0.46,平均多态性信息含量(PIC)为0.56。广东茶树资源遗传多样性的上述6个参数均小于广西茶树资源。广东白毛茶NA和H低于广东茶,NE、He、Ho和PIC与茶较为接近;广西白毛茶NA大于广西茶,但是NE、He和H低于茶。F-统计量分析表明白毛茶与茶种群内近交系数(Fis)、种群间近交系数(Fit)和种群遗传分化(Fst)都较低,基因流(Nm)都较高。广东白毛茶与广西白毛茶Fst为0.04,基因交流相对较低为6.26。AMOVA分析显示组群间遗传变异为3.09%,组群内种群间遗传变异为2.22%,种群内遗传变异为94.69%。群体遗传结构显示105份茶树资源可分为3个类群,类群Ⅰ由6份选育品种组成;类群Ⅱ由43份广东资源和16份广西资源组成;类群Ⅲ包括广西36份和广东4份资源。【结论】广东茶树资源遗传多样性程度低于广西。广东白毛茶遗传多样性比广东茶丰富,种群遗传分化低,存在较频繁的基因交流。广东白毛茶遗传多样性低于广西白毛茶,遗传分化相对较高,基因流较低。AMOVA分析显示遗传变异主要分布于广东、广西茶树资源群体内。

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]广东仁化白毛茶优异株系遗传多样性的EST-SSR分析. 乔小燕,吴华玲,陈栋,李家贤,黄华林,晏嫦妤,何玉媚. 2010

[2]北京油鸡群体世代间遗传结构分析. 杨宇泽,张剑,路永强,张权. 2020

[3]华南鲤选育群体不同世代遗传多样性与遗传结构的微卫星分析. 马冬梅,苏换换,朱华平,黄樟翰. 2018

[4]广东高州7个普通野生稻居群遗传结构的SSR分析. 陈雨,潘大建,曲延英,范芝兰,陈建酉,李晨. 2008

[5]利用EST-SSR标记研究适制绿茶与乌龙茶品种的遗传多样性与遗传结构. 吴晓梅,姚明哲,马春雷,王新超,陈亮. 2010

[6]浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析. 乔婷婷,马春雷,周炎花,姚明哲,刘饶,陈亮. 2010

[7]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011

[8]浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 乔婷婷,马春雷,周炎花,姚明哲,陈亮. 2009

[9]利用EST-SSR分析江北茶区茶树资源的遗传多样性和遗传结构. 姚明哲,刘振,陈亮,王新超,马春雷,梁月荣. 2009

[10]16个茶树品种(系)遗传多样性及遗传结构的SSR标记分析. 王旭,段继华,董丽娟,张曙光. 2011

[11]藏獒群体遗传结构及遗传分化研究. 兰小平,郭宪,陈永昌,杨俊年,鄢珣,崔泰保. 2010

[12]我国十个鹅品种的遗传结构及遗传分化研究. 李慧芳,宋卫涛,徐文娟,朱文奇,汤青萍,陈宽维. 2009

[13]苹果属15个种的叶绿体DNA变异与遗传分化. 高源,王大江,王昆,丛佩华,李连文,朴继成. 2021

[14]我国地方蛋鸭品种遗传结构及遗传分化. 宋卫涛,李慧芳,韩威,朱文奇,徐文娟,陈宽维. 2010

[15]江西地方家鹅资源遗传结构及遗传分化研究. 李慧芳,宋卫涛,谢金防,徐文娟,陈宽维. 2007

[16]甜菜夜蛾地理种群基因流与种群扩张历史分析. 王兴亚,周俐宏. 2015

[17]华南地区大刺鳅的遗传结构与群体动态历史研究. 高尚,李跃飞,李捷,陈蔚涛. 2023

[18]中国甜菜夜蛾地理种群的遗传分化与基因流. 王兴亚,许国庆. 2014

[19]尼罗罗非鱼不同品系间mtDNA D-loop差异分析. 肖炜,李大宇,邹芝英,祝璟琳,韩珏,杨弘. 2016

[20]黄渤海中国对虾6个地理群的遗传结构及其遗传分化. 孟宪红,马春燕,刘萍,王清印,孔杰. 2004

作者其他论文 更多>>

微信小程序