硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任双

作者： 任双;吴俊静;彭先文;张志红;周佳伟;梅书棋;乔木;杜志强

作者机构：

关键词： 硒都黑猪;NT5C1A;核心启动子区;转录因子;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 116-121,128

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因（Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A）启动子区序列的结构特性，确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点，为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测，在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区，根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物，以硒都黑猪血液基因组DNA为模板，通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体，以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测，并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明，NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290～+109bp的位置（ATG作为+1），该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。

分类号： S828.2

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