NaCl胁迫下哈茨木霉ACCC32524的转录组和代谢组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 向杰

作者： 向杰;陈敬师;夏鑫鑫;刘快;李世贵;顾金刚

作者机构：

关键词： 哈茨木霉;NaCl;转录组;代谢组;耐盐机理

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2019 年 011 期

页码： 2165-2181

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]通过分析NaCl胁迫下哈茨木霉(Trichoderma harzianum)ACCC32524转录组和代谢组数据,研究差异表达基因及次级代谢产物的变化情况,初步探索响应NaCl胁迫的分子机制.[方法]利用Illumina HiSeq XTen高通量测序平台完成0、0.4、0.6 mol/L NaCl浓度胁迫培养下哈茨木霉ACCC32524的转录组测序,GC-TOF-MS技术完成对0mol/L和0.6mol/LNaCl胁迫培养下的差异次级代谢产物检测,利用相关软件及数据库对差异表达基因(DEGs)和次级代谢产物的注释、筛选和分类,并进行RT-qPCR验证.[结果]本研究分别得到0.4 mol/L和0.6 mol/L NaCl胁迫下417和733条差异表达基因;GO富集分析显示,分别有318和582条差异表达基因注释到生物学过程、分子功能和细胞组分3个一级分类和40个二级分类;COG分类结果表明分别有232和414条转录本为20个类别,涉及差异表达基因最多的分别为氨基酸的转运和代谢、一般功能预测、碳水化合物的转运和代谢;KEGG代谢途径分析结果表明,分别有75和96条基因归到25个代谢通路中(P≤0.05),其中涉及差异基因最多的是氨基酸的生物合成和2-氧代羧酸代谢通路.从转录组数据中共筛选出与渗透调节、离子转运、活性氧清除等22个耐盐相关基因.0 mol/L和0.6 mol/L NaCl胁迫下的代谢组数据中共筛选出101个差异次级代谢产物,包括8种积累量上调和93种下调物质,其中36个得到定性,分属于糖类、有机酸和氨基酸等9个分类中.RT-qPCR验证挑选的差异表达基因的表达量变化,均与RNA-seq分析结果一致.[结论]NaCl胁迫下引起哈茨木霉ACCC32524基因及次级代谢产物发生明显变化,细胞代谢途径发生明显偏移,这些进程共同作用减少NaCl对细胞的毒害作用,为木霉菌的耐盐机理研究提供重要信息.

分类号： S476

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