猪圆环病毒2型和3型混合感染与遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙莹慧

作者： 孙莹慧;夏叶;陈鹏飞;缪德年

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒;流行特点;遗传进化分析;抗原指数

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2023 年 39 卷 003 期

页码： 67-72

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解临床猪圆环病毒混合感染及其遗传进化情况,利用PCV检测试剂盒对 10 份疑似感染PCV的患病猪的病料进行检测,并对阳性样品进行全基因组克隆与测序分析.结果显示:10 份样品中,PCV1 均为阴性,PCV2 阳性率为90%,PCV3 阳性率为30%,PCV2 与PCV3 混合感染率为30%.全基因组遗传进化结果显示:9 株PCV2 毒株全序列间的核苷酸同源性为 94.5%—100.0%,分属PCV2a、PCV2b、PCV2d和PCV2e基因型,其中PCV2d为优势基因型,占比达55.56%.3 株PCV3 毒株全序列之间核苷酸同源性为99.2%—99.8%.对Cap蛋白氨基酸序列分析发现,PCV3 毒株与PCV2 毒株的亲缘性较远,氨基酸同源性仅为 43.9%—45.1%.PCV3毒株的Cap蛋白抗原指数与参考菌株间差异较小,5 株PCV2d毒株的Cap蛋白抗原指数较疫苗株有明显差异.综上,在临床PCV2 患病猪中PCV2d为优势基因型,且存在一定比例的PCV2 与PCV3 混合感染现象.

分类号： S852.651

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