基于全转录组测序的亚洲柑橘木虱激素生物合成相关基因互作网络构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱莉

作者： 朱莉;吕佳;黄振东;蒲占湑;刘顺民

作者机构：

关键词： 亚洲柑橘木虱;发育;生殖;小RNA;长链非编码RNA;环状RNA

期刊名称： 生物安全学报(中英文)

ISSN： 2095-1787

年卷期： 2025 年 34 卷 003 期

页码： 264-274

摘要： [目的]深入了解亚洲柑橘木虱的转录后调控机制,为丰富亚洲柑橘木虱发育调控网络提供重要分子信息。[方法]基于亚洲柑橘木虱全发育历期混样的全转录组测序,围绕昆虫激素生物合成信号通路进行新转录本挖掘、转录本变异统计、基因结构分析、互作miRNA预测及miRNA-LncRNA和miRNA-CircRNA互作网络构建,使用皮尔逊双变量相关性分析候选miRNA表达与激素相关基因表达间的相关性。[结果]本研究鉴定到25个可注释到昆虫激素生物合成信号通路的新转录本,并发现JH-o-MT、JHEH2、MFE、FOHSDR、ALDH、JHE等基因可能存在新的非编码区域。通过miRNA.预测挖掘到miR-252a-5p、miR-315-5p、miR-71-5p、miR-993-3p、miR-1000-5p、miR-929-5p共6类miRNA可与FOHSDR和JHEH2分别存在互作。进一步构建FOHSDR/JHEH2-miRNA-LncRNA和FOHSDR/HEH2-miRNA-CircRNA互作网络发现,MSTRG.30118.1、MSTRG.16869.1、MSTRG.39461.1、MSTRG.29283.2等8条LncRNA可与5类miRNA存在互作,dcicirc003865、dcicirc001724、dcicirc004421、dciciro006125、dcicirc006016等45条CircRNA与6类miRNA均存在互作。此外,miR-252a-1-5p、miR-315-1-5p、miR-71-2-5p和miR-929-1-5p在取食嫩梢后呈现出低表达水平。实时荧光定量和表达量相关性分析结果指出,miR-929-1-5p与JH合成关键限速酶HMGCR呈高度负相关,miR-252a-1-5p和miR-929-1-5p的表达均与JH合成基因FPPS、FA-o-MT,20E合成基因Sad呈中度负相关。[结论]本研究首次构建了亚洲柑橘木虱FOHSDR/JHEH2-miRNA-LncRNA和FOHSDR/JHEH2-miRNA-CircRNA互作网络,不仅获得了一些具有高连通性的miRNA、LncRNA和CircRNA,还发现miR-252a-1-5p和miR-929-1-5p可能与柑橘木虱取食嫩梢后启动JH和20E生物合成存在重要联系。相关研究结果暗示了这些miRNA、LncRNA和CircRNA在亚洲柑橘木虱激素生物合成的转录后调控中可能存在重要功能,为解析亚洲柑橘木虱发育转录后调控机制提供了重要线索。

分类号：

S436.66

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