牦牛ACAA2基因克隆及组织表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈美
作者: 陈美;柴志欣;武志娟;王会;王吉坤;王嘉博;钟金城;信金伟
作者机构:
关键词: 牦牛;ACAA2基因;克隆;组织表达
期刊名称: 东北农业大学学报
ISSN: 1005-9369
年卷期: 2020 年 51 卷 012 期
页码: 51-57
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为获得牦牛ACAA2基因CDS区序列,研究该基因在牦牛不同组织中表达情况.利用RT-PCR方法克隆类乌齐牦牛ACAA2基因CDS序列并分析生物信息学,荧光定量PCR(qPCR)方法检测ACAA2基因在麦洼牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌和臀肌组织中表达情况.结果表明,ACAA2基因CDS序列全长为1194 bp,开放阅读框为1101 bp(GenBank登录号:MT861180),共编码366个氨基酸;同源性比对分析显示,牦牛和黄牛亲缘关系最近,其次是马,其ACAA2基因核苷酸序列同源性分别达92.0%和88.7%;ACAA2蛋白亲水性平均值为-0.127,不稳定指数(Ⅱ)为40.88,为不稳定蛋白;无信号肽和跨膜结构,属于非分泌蛋白;存在14个丝氨酸(Ser)、10个苏氨酸(Thr)和4个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;组织表达分析显示,ACAA2基因在牦牛肾脏和肝脏组织中表达差异极显著,在胸肌和臀肌中表达量最低.研究为初步探究ACAA2基因在牦牛脂肪代谢中作用提供理论依据.
分类号: S823
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