基于转录组测序探究乌鳢皮肤白化的分子机制

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李岩

作者： 李岩;周燕;雷骆;苏建;樊威;罗煜;李俊婷;高贺;周朝伟

作者机构：

关键词： 白乌鳢;转录组测序;皮肤;生物信息学分析;皮肤白化

期刊名称： 水产科学

ISSN： 1003-1111

年卷期： 2022 年 41 卷 005 期

页码： 715-726

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究乌鳢白化的分子调控机理,采用Illumina HiSeq技术对白乌鳢和乌鳢皮肤组织进行高通量转录组测序.结果显示,白乌鳢皮肤组织与乌鳢皮肤组织中差异表达基因数为694个.GO信号通路分析发现,上述差异表达基因主要富集在细胞进程、代谢过程、细胞联接和转运活性等通路上.KEGG信号通路分析显示,差异基因显著富集在与皮肤白化相关的酪氨酸代谢通路上.转录组单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失标记(INDEL)分析发现,相对于乌鳢,白乌鳢纯合型单核苷酸多态性和插入缺失标记位点数目多,而杂合型单核苷酸多态性和插入缺失标记位点数目少.基于转录组单核苷酸多态性和插入缺失标记的结果,筛选出酪氨酸代谢通路上的差异表达基因,黑尿酸酶基因和乙醇脱氢酶5基因存在单核苷酸多态性错义突变,而酪氨酸酶相关蛋白1基因未找到突变位点.试验结果表明,乌鳢皮肤白化除与酪氨酸代谢通路有关,还可能与黑色素沉积相关基因表达量下降导致皮肤中色素沉积减少有关.试验结果将丰富白乌鳢和乌鳢的基因资源,为进一步探究乌鳢白化的分子调控机制奠定基础.

分类号： S965.125

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