沃柑辐射诱变系渝沃无核的果实品质及遗传差异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭洁

作者： 彭洁;余歆;朱延松;杨胜男;程莉;李仁静;江东

作者机构：

关键词： 渝沃无核;果实品质;RNA-seq;全基因组重测序;遗传差异

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 2119-2134

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】从果实品质和分子水平上解析造成沃柑辐射诱变系渝沃无核重要表型差异的主要遗传因素,为后续柑橘品种遗传改良奠定基础。【方法】观测渝沃无核的果实品质,应用RNA-seq技术和全基因组重测序揭示渝沃无核的差异表达基因（differential expression genes,DEGs）及基因组的遗传差异。【结果】相比沃柑,渝沃无核的种子数量少、成熟期提前、果皮变厚和剥皮较难,其可溶性固形物含量、固酸比和抗坏血酸含量高,可滴定酸、转化糖含量低。渝沃无核的串联重复序列占基因组的3.44%,其所在位置基因的GO功能富集和KEGG通路富集主要涉及代谢过程和次生代谢物合成,其中只涉及RNA聚合酶活性、与物质的跨膜运动有关的ATPase活性、半乳糖代谢和过氧化物酶途径。DEGs的GO功能富集涉及碳水化合物代谢、氧化还原过程和β-半乳糖苷酶复合物,KEGG通路富集涉及苯丙素生物合成、内质网蛋白加工和次生代谢物合成。【结论】渝沃无核成熟期早,种子数量少,品质更优。渝沃无核与沃柑的串联重复序列的数目和位置存在差异;苯丙素生物合成、内质网蛋白加工、次生代谢物合成、糖代谢和植物激素有关途径及花粉相关DEGs存在差异。

分类号： S666

  • 相关文献

[1]基于重测序的籽粒型和鲜食型大豆的全基因组变异分析. 郭丹丹,袁凤杰,郁晓敏. 2019

[2]利用重测序InDel位点开发甜椒隐性核不育分子标记. 孟雅宁,严立斌,田玉,范妍芹. 2019

[3]韩国赤芝全基因组重测序分析. 朱风丽,徐晓兰,陈体强,石林春,缪晓青,兰进. 2019

[4]马早期流产相关功能基因挖掘的研究. 吴海青,刘威,马跃军,苏少锋,萨初拉,付绍印,高文渊,李玉荣. 2021

[5]特早花甘蓝型油菜的开花特征及特早花候选基因鉴定. 余华胜,张冬青,陈佳麒,张尧锋,傅鹰. 2021

[6]全基因组重测序在大豆育种上的研究进展. 赵海红,郭泰,王志新,郑伟,李灿东,徐杰飞,张振宇,赵星棋,王士强. 2020

[7]水稻特大穗恢复系R1126株叶型性状遗传基础剖析. 孙平勇,舒服,何强,邓华凤. 2013

[8]全基因组重测序解析不同牦牛类群的系谱及遗传结构. 王佟,马晓明,余道宁,马超凡,潘和平,梁春年,扎西塔,阎萍. 2023

[9]离子束诱变体水稻JD-1的表型及基因组变异分析. 敬银钦,高方远,刘利平,苏相文,任明鑫,陆贤军,吕建群,金文杰,胡运高,任鄄胜,任光俊. 2021

[10]基于全基因重测序的芒果细菌性角斑病抗性相关SNP分析. 徐志豪,周思思,詹儒林,姚全胜,柳凤. 2024

[11]禾荔特晚熟焦核突变体GLL-1全基因组变异分析. 丁峰,李浩然,王金英,彭宏祥,何新华,黄小雄,李平,钟敏芝,覃燕,张树伟. 2021

[12]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 2016

[13]三倍体香蕉优良品种‘Grand Nain’全基因组变异挖掘. 邵秀红,胡春华,盛鸥,毕方铖,邓贵明,杨乔松,易干军. 2018

[14]猪源艰难梭菌的分离鉴定与生物学特性分析. 张悦,艾伟诚,王斐,梁婉,谢思思,华琳,李春辉,彭忠,吴斌. 2022

[15]基于全基因组重测序研究文昌鸡产蛋性能的影响因素. 任钰为,陈星,林燕宁,黄潇仙,洪玲玲,王峰,孙瑞萍,张艳,刘海隆,郑心力,晁哲. 2024

[16]甘蓝型油菜恢复系的群体结构解析及核心种质构建. 张格格,柳海东,杜德志. 2023

[17]五指山猪和杜洛克猪全基因组选择信号差异分析. 任钰为,王峰,王成,张艳,孙瑞萍,刘海隆,乔传民,邢漫萍,黄丽丽,曹宗喜,晁哲. 2022

[18]连云港地区野生灵芝生物学特性及基因组特征分析. 纪伟,苏文英,刘晓梅,任立凯,胡曙鋆,孙潇潇,陈克龙. 2024

[19]基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证. 刘浩然,张晨禹,龚洋,叶圆圆,陈杰丹,陈亮,刘丁丁,马春雷. 2023

[20]毒害艾美耳球虫疫苗ENYS株TaqMan qPCR检测方法的建立. 靳浩展,肖文婉,廖申权,戚南山,李娟,吕敏娜,蔡海明,胡俊菁,林栩慧,宋勇乐,陈祥杰,朱易斌,尹理君,张健騑,张旭,孙铭飞. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序