小麦组蛋白TaHis3.2的克隆及盐胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴丹萌

作者： 吴丹萌;梁丹;刘丹;张欣;胡子全;王志强;梁晨;刘一晓;潘萍萍;王从磊;袁卉馥;王建贺

作者机构：

关键词： 小麦;盐胁迫;组蛋白;基因表达;生物信息学方法

期刊名称： 山西农业科学

ISSN： 1002-2481

年卷期： 2022 年 50 卷 008 期

页码： 1197-1203

摘要： 为了研究组蛋白编码基因的表达是否受到渗透胁迫的诱导及探讨利用组蛋白编码基因开发分子标记,辅助耐盐育种的可能,以小麦(Triticum aestivum L.)为研究对象,通过NaCl渗透胁迫,从根叶组织的RNA-seq挖掘到一个表达受到盐胁迫影响的组蛋白编码基因His3.2出发,利用同源克隆法从小麦中获得His3.2基因,通过生物信息学方法分析其蛋白序列特征,使用HMMER软件、PF00125结构域进行全家族调取,并利用FPKM算法分析其组织表达特异性以及盐胁迫响应模式.结果表明,共得到2种TaHis3.2序列,开放阅读框长411 bp,存在8个SNP,编码同一种氨基酸;氨基酸结构域预测发现,TaHis3.2包含Histon保守结构域PF00125;小麦中该家族共398个成员,在各个染色体上均有分布,且主要分布在染色体的两端.表达分析显示,TaHis3.2主要在根部表达,盐胁迫抑制该基因的表达.自然群体序列分析发现,在D基因组该基因高度保守,未发现品种间存在序列差异.

分类号： S512.1

  • 相关文献

[1]高温胁迫下不同玉米花粉组蛋白Zm-H3基因的克隆及表达分析. 徐劲松,杨海鹏,张红梅,刘小红,郝耀山,孙毅. 2021

[2]水稻Histone3同源蛋白序列和基因表达特性分析. 胡明瑜,白文钦,潘晓雪,吴红,雷开荣. 2019

[3]基因组;基因表达与饲料. CliffordAAdams,岳洪源,齐广海,李海涛. 2008

[4]莜麦AnHRGP基因的生物信息学分析. 刘文英,田宏先,王润梅,周凤,刘建霞,刘丽珍. 2019

[5]基于元分析和生物信息学分析的玉米抗旱相关性状QTL一致性区间定位. 栗文娟,刘志斋,石云素,宋燕春,王天宇,徐辰武,黎裕. 2010

[6]向日葵ACC氧化酶基因(HaACO1)的克隆及表达分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,乔慧蕾,聂惠,安玉麟. 2015

[7]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022

[8]盐胁迫下胡萝卜肉质根中木质素响应机理研究. 陈皓炜,陈梦娇,王雅慧,张榕蓉,王欣蕊,徐志胜,谭国飞,熊爱生. 2021

[9]杜梨响应盐胁迫CIPK01的克隆及表达分析. 王影,李慧,蔺经,杨青松,常有宏. 2019

[10]日本结缕草ZjNAC3基因在盐胁迫中的功能. 姜红岩,范希峰,温海峰,韩朝,滕文军,滕珂,尹淑霞. 2021

[11]盐胁迫对萝卜幼苗生长及RsCAT和RsSOD基因表达的影响. 王庆彪,王艳萍,令狐波,钱慧慧,赵秋菊,张丽. 2021

[12]60Co-γ射线辐照对盐胁迫下杂交桑幼苗部分生理生化性状的影响. 赵东晓,董亚茹,耿兵,施新琴,孙景诗,薄颖颖,王照红,娄齐年. 2020

[13]盐胁迫下3个地域来源桑种子的萌发率及部分生化性状差异. 班月圆,方荣俊,杜伟,殷朝瑞,曹旭,刘利,程嘉翎. 2016

[14]玉米热激转录因子基因ZmHsf06表达提高拟南芥耐盐性. 李国良,李孟军,刘子会,张华宁,郭秀林. 2016

[15]盐胁迫下苗期栽培大豆生理响应及Na~+动态平衡关键基因的表达. 宁丽华,张大勇,刘佳,何晓兰,万群,徐照龙,黄益洪,邵宏波. 2016

[16]小麦水通道蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在盐和干旱胁迫响应中的作用(英文). 马东方,胡义锋,牛红莉,曾凡松. 2021

[17]苏北沿海地区不同小麦品种发芽期耐盐性鉴定. 任立凯,王龙,李筠,浦汉春,李强,孙中伟. 2012

[18]盐胁迫对小麦种子萌发与幼苗生长的影响及外源物质调控效应. 王康君,王龙,顾正中,李筠,任立凯,李强,孙中伟. 2016

[19]水杨酸和阿斯匹林对小麦盐害的缓解作用. 张士功,高吉寅,宋景芝. 1999

[20]基于物种敏感性分布(SSD)的耐盐与Pb低吸收小麦筛选研究及应用. 孟楠,王萌,雷小琴,陈莉,郑涵,陈世宝. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序