柑橘溃疡病菌纤维素酶的信息学和三种内切葡聚糖苷酶的作用方式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡军华

作者： 胡军华;李永胜;姚廷山;赵永安;周娜

作者机构：

关键词： 柑橘溃疡病菌;纤维素酶;酶学机制;生物信息学分析

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2015 年 32 卷 05 期

页码： 934-942

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究柑橘溃疡病菌(Xac)纤维素酶的结构功能特点及其可能的作用机制。【方法】通过生物信息学分析,获得Xac纤维素酶的等电点、分子质量、信号肽、结构域和功能等特点。选取其中的Xaccel1、Xaccel3及Xaccel5基因进行克隆和表达,并对重组蛋白进行酶学分析。【结果】Xac纤维素酶共有22个蛋白,分成11组;Xac纤维素酶多在350aa左右,63.6%具有信号肽;具有GH5、GH8、GH9及GH12 4个糖基水解酶家族模块,具有GH5模块的纤维素酶占Xac纤维素酶的54.5%。此外,Xac的纤维素酶还具有CMB2、Cel D_N、TAT等功能模块。与Xanthomonas属其他纤维素酶比对发现,Xac纤维素酶在整个Xanthomonas属均有同源蛋白,与X.campestris pv.vesicatoria(Xcv)的纤维素酶同源性最高,所具有的功能性结构域的种类和个数比较接近。重组蛋白Xaccel1和Xaccel3为内切葡聚糖苷酶,它们的主要的作用方式为随机地断裂各底物的β-1,4糖苷键,对相应的糖进行降解。Xaccel5也具有内切葡聚糖苷酶活性,仅能作用于底物的还原末端的β-1,4糖苷键。3个纤维素酶具体的作用机制还需进一步的试验证明。【结论】Xac纤维素酶中Xaccel1(具有GH12)可以利用多种糖类,与Xaccel3(GH5/CBM2)均为内切葡聚糖苷酶,主要的作用方式为随机地断裂各底物的β-1,4糖苷键,对相应的糖进行降解。Xaccel5(GH5)也具有内切葡聚糖苷酶活性,仅能作用于底物的还原末端的β-1,4糖苷键。

分类号： S436.66

  • 相关文献

[1]柑橘溃疡病菌的侵染过程及噻森铜对溃疡病的防治效果. 杨贵兵,韩健,李文星,金燕,马先锋,邓子牛. 2021

[2]利用rep-PCR技术研究我国9省柑橘溃疡病菌遗传多样性. 姚廷山,胡军华,唐科志,冉春,李中安,周常勇. 2010

[3]柑橘溃疡病菌检测方法及防治技术研究进展. 肖伏莲. 2012

[4]GST pull-down联合LC-MS/MS筛选柑橘抗溃疡病转录因子CsBZIP40的互作蛋白. 窦万福,祁静静,胡安华,陈善春,彭爱红,许兰珍,雷天刚,姚利晓,何永睿,李强. 2019

[5]柑橘溃疡病菌一个单功能域反应调控蛋白的功能研究. 李瑞芳,刘倩倩,姚姿婷,贤小勇,陆光涛,朱桂宁. 2024

[6]凝胶过滤层析分离纯化纤维素酶的研究. 王玢,袁方曜. 2003

[7]复合酶和寡糖在奶牛日粮中的应用研究. 呼和,李胜利,卢德勋,刘亚力,冯新雨. 2006

[8]影响稻草降解及其产纤维素酶的几个关键性因素. 辛婷,张兴,谢逸萍,吕巧玲,葛义杰,马代夫,王慧. 2008

[9]紫外诱变对血红铆钉菇菌丝纤维素酶活性影响. 李天芝,李莉,周健树,孟庆国. 2009

[10]基于Taguchi试验设计稻草发酵产纤维素酶的优化. 辛婷,谢逸萍,张兴,马代夫,王慧. 2009

[11]里氏木霉纤维二糖水解酶基因cbh1的分子改造. 张穗生,黄俊,雷富,陈东. 2014

[12]酶法制取玉米水溶性膳食纤维的研究. 祝美云,侯传伟,魏书信,陆丽利. 2008

[13]厌氧梭菌表达载体在大肠杆菌中的直接表达及活性筛选. 陈燕,黄金群,裴建新,庞浩. 2013

[14]纤维素酶法提取双孢菇废弃菇柄核酸工艺优化. 沈琪,李顺峰,王安建,侯传伟,魏书信. 2014

[15]酶法辅助提取金柑皮总黄酮的工艺优化研究. 陈源,潘东明,郭金鹏,林俊. 2011

[16]纤维素酶与淀粉酶降解壳聚糖的动力学研究. 何子平,邓光辉,黄在银,谭学才. 2003

[17]古菌、细菌和真核生物纤维素酶的整体进化关系（英文）. 吴光. 2016

[18]碱性纤维素酶产生菌株的筛选及其酶学性质研究. 董园,芦志龙,陈东,黄日波. 2014

[19]产纤维素酶新菌株的筛选及其产酶特性研究. 张穗生,吴仁智,陈东,黄日波. 2014

[20]产纤维素酶大肠杆菌工程菌的构建和酶的表达. 芦志龙,吴仁智,陈英,黄俊,陆琦,陈东. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序