广东番茄曲叶病毒G3分离物基因组DNA-A的分子特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何自福

作者： 何自福;虞皓;罗方芳

作者机构：

关键词： 广东番茄曲叶病毒G3;DNA-A;序列分析;分子特征

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2005 年 35 卷 03 期

页码： 208-213

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从采集于广东花都的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物ToLCGDV-[G3],序列分析结果表明,其DNA-A为单链环状,全长2744nt,共有6个ORFs,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4。BLAST结果显示,与ToLCGDV-[G3]基因组有同源关系的均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属。进一步比较结果表明,ToLCGDV-[G3]与有同源性的菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A全序列同源率最高为87·9%。其中IR的同源率为59·0%~85·3%,而AV1、AV2、AC1、AC2、AC3和AC4这6个ORFs同源率分别为73·6%~95·2%、64·0%~95·4%、71·7%~87·7%、69·6%~93·9%、67·7%~95·1%和64·1%~94·2%,它们各自编码的氨基酸序列同源率分别为76·3%~99·2%、52·6%~95·7%、69·7%~88·1%、51·9%~88·9%、63·4%~92·5%和33·0%~90·7%。系统进化关系分析结果显示,ToLCGDV-[G3]与ToLCGDV-[G2]亲缘关系最近,二者组成一个独立的分支,与其它40种菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远。因此,ToLCGDV-[G3]可能是一个先前未报道的双生病毒科菜豆金色花叶病毒属新种。

分类号： S436.412

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