蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李冬梅

作者： 李冬梅;吕复兵;朱根发;洪彦彬;陈小平;梁炫强;操君喜;孙映波

作者机构：

关键词： 蝴蝶兰;EST;SSR信息

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2011 年 38 卷 03 期

页码： 117-120

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%;AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%),AT/AT次之(18.6%)。根据搜索结果设计了100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物,其中12对引物扩增的产物存在多态性。

分类号： S682.31

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