吉富罗非鱼IGF2基因分离及其单核苷酸多态性与体型、增重相关性

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈雪峰

作者: 陈雪峰;杨国梁;俞菊华;唐永凯;李建林

作者机构:

关键词: 吉富罗非鱼;胰岛素样生长因子2;单核苷酸多态性;基因型;体型;增重;相关性

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2010 年 45 卷 02 期

页码: 107-114

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 胰岛素样生长因子2(insulin-like growth factor2,IGF2)是控制动物生长和脂肪沉积的重要基因之一。本文采用PCR方法分离了吉富罗非鱼(GIFT strain Nile tilapia Oreochromis niloticus)IGF2基因5475bp,包含由4个外显子组成的整个阅读框669bp以及3个内含子。通过比对吉富罗非鱼10个个体IGF2序列,共发现11处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,本文检测了内含子1的621nt(C/T)和外显子3的161nt(A/G)两位点在192尾吉富罗非鱼中的基因型分布,并分析不同基因型与体型、增重的相关性。使用四引物扩增受阻体系PCR检测内含子1的621nt基因型,结果显示,CC、CT、TT基因型频率在雄鱼中分别为0.32、0.32、0.36,在雌鱼中分别为0.38、0.38、0.24;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼体型(体高/体长)显著相关(P<0.05),CC型个体显著高于CT和TT型个体。外显子3的A/G转换导致了MSPⅠ酶切位点改变,使用PCR-RFLP法检测该位点基因型,结果显示整个群体中不存在AA基因型,在雄鱼中,GG、AG基因型频率分别为0.71、0.29,而雌鱼中则为0.75和0.25;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼增重极显著相关(P<0.01),GG型的雄鱼明显较AG型增重快。

分类号: S917.4

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