基于SSR标记的百合资源遗传背景分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩嘉琪

作者： 韩嘉琪;王海平;宋江萍;贾会霞;张晓辉;李森;徐楚;李芝洁;阳文龙

作者机构：

关键词： 百合;种质资源;遗传背景;简单序列重复（SSR）

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 1211-1224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究百合（Lilium spp.）种质资源的遗传背景，精准评价和筛选优异种质用于百合的遗传改良，本研究采用简单序列重复（simple sequence repeat, SSR）分子标记技术对来自我国11个省份的62份百合种质资源进行了遗传背景分析。结果表明，83对百合SSR引物中有15对引物具有多态性，共扩增出157个等位基因位点，每个位点的等位基因数为5-19个，平均每个位点有效等位基因数（number of effective alleles, Ne）为4.162 8，平均观测杂合度（observed heterozygosity, Ho）和平均期望杂合度（expected heterozygosity,He）分别为0.2282和0.6941，平均多态性信息含量（polymorphism information content, PIC）为0.678 8，平均Nei’s多样性指数（Nei’s diversity index, H）和平均Shannon信息指数（Shannon’s information index, I）分别为0.694 1和1.594 9，说明供试百合种质遗传多样性丰富。利用非加权配对算术平均法（unweighted pair group method with arithmetic mean,UPGMA）进行聚类分析，可将62份种质分为5大类，主成分分析将材料分为3个类群，结合两种分析发现各类群存在一定地理相关性，绝大数来源相同的百合种质可聚为一类。群体结构分析将百合群体划分为4个类群和1个混合类群。上述研究结果为百合种质资源的精准鉴定和育种利用提供了一定的理论依据和基因资源。

分类号： S682.29

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