印度南瓜Na+/H+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 时丕彪

作者： 时丕彪;洪立洲;王军;费月跃;王伟义;吕远大;顾闽峰

作者机构：

关键词： 印度南瓜;CmaSOS1基因;基因克隆;序列分析;表达分析

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2020 年 012 期

页码： 2638-2646

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Na+/H+逆向转运蛋白(SOS1)是植物耐盐的关键因子之一,在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用.为解析印度南瓜SOS1基因的序列特征和功能,利用生物信息学和分子生物学方法对其进行研究.结果表明,克隆获得印度南瓜SOS1基因cDNA全长序列,命名为CmaSOS1,GenBank登录号:NW019272028.序列分析表明,CmaSOS1基因的cDNA全长3 940 bp,包含一个3 429 bp的开放阅读框架,编码1 142个氨基酸.CmaSOS1基因含有23个外显子和22个内含子,全长46 314 bp.CmaSOS1蛋白的分子量为126.7 kDa,理论等电点为5.92,包含12个跨膜结构区域,具有一个NaHExchanger superfamily结构域和一个CAPED superfamily结构域;CmaSOS1蛋白属于疏水性稳定蛋白,二级结构元件多为无规卷曲和α-螺旋.CmaSOS1蛋白与葫芦科的中国南瓜、西葫芦、甜瓜、黄瓜和苦瓜Na+/H+逆向转运蛋白的同源性较高,序列一致性分别为98%、98%、90%、89%和89%.实时荧光定量PCR分析表明,CmaSOS1基因在印度南瓜的根和叶中表达量较高,在茎、花、果实中的表达量较低;该基因受NaCl和聚乙二醇(PEG)诱导后均呈上调表达,推测CmaSOS1基因可能在印度南瓜抵御盐分胁迫和干旱胁迫过程中发挥重要作用.本研究为进一步揭示CmSOS1在非生物胁迫下的功能奠定了基础.

分类号： S642.1

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