澳洲坚果bHLH基因家族成员MibHLH48的结构与功能分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王文林
作者: 王文林;陈海生;张涛;郑树芳;樊松乐;王萌;谭秋锦;韦媛荣;黄锡云
作者机构:
关键词: 澳洲坚果;MibHLH48;电子克隆;生物信息学;产量
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2021 年 015 期
页码: 4950-4958
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: bHLH (Basic/helix-loop-helix)转录因子具有螺旋-环-螺旋结构,在植物中参与调控植物体生长发育、信号传导和抗逆生理等过程。澳洲坚果含有丰富的具有药用和保健价值的营养物质,但其产量和品质问题影响了澳洲坚果产业在中国的发展。为分析bHLH家族成员在澳洲坚果产量形成中的结构与功能,本研究采用电子克隆技术对MibHLH48进行组装拼接,并利用生物信息学方法对其结构进行分析预测。结果表明,MibHLH48 cDNA全长为1 838 bp,开放阅读框的长度为669 bp,共编码222个氨基酸;MibHLH48蛋白存在bHLH结构域,定位于细胞核、无信号肽、无跨膜结构的稳定亲水的bHLH家族蛋白。同源分析表明MibHLH48与荷花NnbHLH48氨基酸序列同源性最高。系统进化分析将MibHLH48与拟南芥AT3G-57800.1 (bHLH060)、AT2G42300.1 (bHLH048)聚为一枝。利用转录组数据分析MibHLH48基因在‘桂热一号’和‘695’澳洲坚果品种枝条、花和叶片中的表达模式表明,MibHLH48在‘桂热一号’品种花中的表达量最高,‘695’品种花中的表达量最低。推测MibHLH48与澳洲坚果产量形成相关。研究结果为研究MibHLH48基因在澳洲坚果中花发育的机理和产量形成机制的作用打下基础。
分类号: S664.9
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