澳洲坚果bHLH基因家族成员MibHLH48的结构与功能分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王文林

作者: 王文林;陈海生;张涛;郑树芳;樊松乐;王萌;谭秋锦;韦媛荣;黄锡云

作者机构:

关键词: 澳洲坚果;MibHLH48;电子克隆;生物信息学;产量

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2021 年 015 期

页码: 4950-4958

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: bHLH (Basic/helix-loop-helix)转录因子具有螺旋-环-螺旋结构,在植物中参与调控植物体生长发育、信号传导和抗逆生理等过程。澳洲坚果含有丰富的具有药用和保健价值的营养物质,但其产量和品质问题影响了澳洲坚果产业在中国的发展。为分析bHLH家族成员在澳洲坚果产量形成中的结构与功能,本研究采用电子克隆技术对MibHLH48进行组装拼接,并利用生物信息学方法对其结构进行分析预测。结果表明,MibHLH48 cDNA全长为1 838 bp,开放阅读框的长度为669 bp,共编码222个氨基酸;MibHLH48蛋白存在bHLH结构域,定位于细胞核、无信号肽、无跨膜结构的稳定亲水的bHLH家族蛋白。同源分析表明MibHLH48与荷花NnbHLH48氨基酸序列同源性最高。系统进化分析将MibHLH48与拟南芥AT3G-57800.1 (bHLH060)、AT2G42300.1 (bHLH048)聚为一枝。利用转录组数据分析MibHLH48基因在‘桂热一号’和‘695’澳洲坚果品种枝条、花和叶片中的表达模式表明,MibHLH48在‘桂热一号’品种花中的表达量最高,‘695’品种花中的表达量最低。推测MibHLH48与澳洲坚果产量形成相关。研究结果为研究MibHLH48基因在澳洲坚果中花发育的机理和产量形成机制的作用打下基础。

分类号: S664.9

  • 相关文献

[1]猪SRPK1基因的电子克隆. 俄广鑫,刘娣,谢雨彤,祝继原,杨少成,王嘉博,赵金凤. 2010

[2]绵羊LDHAL6A基因的电子克隆与生物信息学预测. 闫秋良,翟洪军,马惠海,金海国,李双双,曹阳,武斌,赵玉民. 2013

[3]甜樱桃PaGAST基因的电子克隆及生物信息学分析. 李菊,谢红江,杨文渊,陶炼,李洪雯. 2018

[4]小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释. 王长彪,韩斌,刘江,崔婷,任永康,赵兴华,董艳辉,李亚丽,唐朝晖. 2016

[5]香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析. 谭琳,康由发,郑晓燕,黄丽娜,陈娇,马蔚红. 2015

[6]猪CAPN2基因的生物信息学分析. 王学敏,李碧侠,任守文. 2008

[7]生物信息学在发现新基因方面的应用. 冯浩咏,苗向阳,罗绪刚,胡婕. 2007

[8]大麦MBF1基因的电子克隆与生物信息学分析. 秦丹丹,许甫超,董静,葛双桃,李梅芳. 2014

[9]牛PSME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007

[10]巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析. 高静中国热带农业科学院科技信息研究所,程汉,蔡海滨,安泽伟,黄华孙. 2010

[11]奶牛乳房炎抗性相关基因Znf313的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2006

[12]陆地棉GhNIP5.1基因的电子克隆及生物信息学分析. 巩元勇,郭书巧,束红梅,何林池,倪万潮. 2013

[13]一个新的玉米WRKY基因识别及其生物信息学分析. 胡守景,张治礼. 2008

[14]葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析. 郑建立,高峰,田永生,高建杰,帅建军,彭日荷,熊爱生,姚泉洪. 2011

[15]森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析. 王静,赵密珍,王壮伟,吴伟民,钱亚明. 2011

[16]向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析. 孟鹏,李根英,陈国强,王振东. 2012

[17]长穗偃麦草ThPLA基因的电子克隆和生物信息学分析. 张宴萍,黄德华,李鹏,崔正勇,何方,闫百蔷. 2024

[18]木薯MADS-box基因克隆及其响应乙烯信号的表达模式分析. 廖文彬,王淦,彭明. 2013

[19]割手密谷胱甘肽硫转移酶基因SsGST的克隆与生物信息学分析. 徐磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘洋. 2015

[20]牛PS ME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007

作者其他论文 更多>>