基于转录组测序筛选烟草响应疫霉侵染的候选基因

文献类型: 中文期刊

第一作者: 孙计平

作者: 孙计平;王亚乐;李雪君;平文丽;孙焕

作者机构:

关键词: 转录组;疫霉;河洛1号;烟草

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 003 期

页码: 457-467

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 疫霉属真菌是主要的植物病原菌,会对很多作物造成毁灭性伤害,为挖掘烟草响应疫霉侵染的候选基因,用烟草疫霉菌侵染河洛1号幼苗,通过转录组测序技术,对疫霉菌侵染前与侵染后24 h和48 h的差异表达基因(DEG)进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术验证。结果表明,疫霉菌侵染后24 h和48 h分别筛选出DEG 4 563个和14 053个,共同变化的基因3 623个,其中1 502个上调差异表达基因被GO基因组注释,主要富集在谷胱甘肽代谢过程和蛋白质磷酸化生物学过程;787个下调差异表达基因被GO基因组注释,主要富集在转录调控。KEGG富集分析结果显示,差异表达基因主要富集在植物-丝裂原活化蛋白激酶信号通路、植物激素信号转导通路和植物-病原菌互作通路。植物-病原菌互作通路中FLS2上调促进MEKK1磷酸化,诱导蛋白激酶MPK4,引起WRKY12持续下调表达,WRKY9、WRKY24、WRKY26、WRKY31、WRKY33、WRKY40持续上调表达;诱导蛋白激酶MPK3/6表达,引起WRKY11、WRKY15、WRKY17和WRKY41上调表达,导致PR-1基因持续下调表达,河洛1号植株感病。

分类号: S435.72

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