基于转录组测序筛选烟草响应疫霉侵染的候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙计平

作者： 孙计平;王亚乐;李雪君;平文丽;孙焕

作者机构：

关键词： 转录组;疫霉;河洛1号;烟草

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2025 年 41 卷 003 期

页码： 457-467

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 疫霉属真菌是主要的植物病原菌，会对很多作物造成毁灭性伤害，为挖掘烟草响应疫霉侵染的候选基因，用烟草疫霉菌侵染河洛1号幼苗，通过转录组测序技术，对疫霉菌侵染前与侵染后24 h和48 h的差异表达基因(DEG)进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析，并利用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术验证。结果表明，疫霉菌侵染后24 h和48 h分别筛选出DEG 4 563个和14 053个，共同变化的基因3 623个，其中1 502个上调差异表达基因被GO基因组注释，主要富集在谷胱甘肽代谢过程和蛋白质磷酸化生物学过程；787个下调差异表达基因被GO基因组注释，主要富集在转录调控。KEGG富集分析结果显示，差异表达基因主要富集在植物-丝裂原活化蛋白激酶信号通路、植物激素信号转导通路和植物-病原菌互作通路。植物-病原菌互作通路中FLS2上调促进MEKK1磷酸化，诱导蛋白激酶MPK4,引起WRKY12持续下调表达，WRKY9、WRKY24、WRKY26、WRKY31、WRKY33、WRKY40持续上调表达；诱导蛋白激酶MPK3/6表达，引起WRKY11、WRKY15、WRKY17和WRKY41上调表达，导致PR-1基因持续下调表达，河洛1号植株感病。

分类号： S435.72

  • 相关文献

[1]烟叶衰老过程中类胡萝卜素代谢及相关基因表达分析. 文利超,吴凤燕,李伟,郭永峰. 2019

[2]过表达NtH202烟草叶片响应烟蚜侵袭转录组分析. 孙计平,王亚乐,李雪君,孙焕,平文丽. 2024

[3]青枯菌侵染下不同类型烟草根系转录组比较分析. 章慧芬,张玉芹,曹长代,孙刚,温亮,刘洋,刘正文,肖志亮,耿锐梅,任民,李丽华,杨爱国. 2024

[4]贵州辣椒疫霉种群的组成与分布. 陈小均,吴石平,谭清群,何海永,杨学辉. 2014

[5]柑桔树疫霉的蛋白质聚丙烯酰胺凝胶盘状电泳. 先宗良,胡义文,杨大旗. 1990

[6]一株疫病拮抗青霉P.st10菌株的抗菌活性及其对辣椒疫病的盆栽防效. 马艳,常志州,赵江涛,黄红英,叶小梅,张建英. 2006

[7]辣椒CaSYT1的鉴定及其在疫霉侵染过程中的功能初探. 刘艳艳,丁颖,刘兴华,郑佳秋,刘志钦. 2024

[8]铜绿假单胞菌结合生物熏蒸防控辣椒疫病的效果. 王秋君,常志州,王光飞,马艳. 2015

[9]太阳能消毒的研究综述. 曹坳程. 2008

[10]食线虫真菌的研究进展. 刘杏忠,裘维蕃. 1991

[11]我国热区疫霉种的分布、疫病及其防治研究进展. 唐庆华,宋薇薇,朱辉,牛晓庆,余凤玉,韩超文,吴多扬,覃伟权. 2011

[12]海南番木瓜疫病病原菌鉴定与ITS序列分析. 罗霓,王超,何凡,郭利军,范鸿雁,何舒. 2015

[13]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[14]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[15]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[16]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016

[17]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013

[18]黄瓜共表达基因模块的识别及其特点分析. 林行众,张忠华,杨清,黄三文. 2015

[19]海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析. 李秋莹,张杰,姚建亭,王秀良,段德麟. 2016

[20]基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析. 张梅,米铁柱,甄毓,王华龙. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序