两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张凤英

作者： 张凤英;马凌波;施兆鸿;夏连军;马春艳

作者机构：

关键词： 鲷属;线粒体DNA;细胞色素氧化酶I亚基基因;序列分析

期刊名称： 上海水产大学学报

ISSN： 1004-7271

年卷期： 2006 年 15 卷 04 期

页码： 403-408

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用通用引物成功扩增了黄鳍鲷和黑鲷的线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因序列。通过序列测定,得到581 bp的基因片段,碱基A、T、G、C平均含量分别为25.8%、32.6%、18.0%和23.6%,序列中的A+T含量明显高于G+C含量,与其他鱼类的COI基因片段研究结果相一致。通过序列分析发现黄鳍鲷和黑鲷两序列共存在14处碱基变异,其中在第19~139 bp之间检测到13个变异位点,是变异频率较高的区段,可以考虑作为鲷属或者种群鉴别的分子标记。与黄鲷、真鲷、三长棘真鲷等鱼类比较,无插入和缺失位点,转换明显高于颠换。序列差异比较结果显示,真鲷与黄鳍鲷的序列差异在这5种鱼类中最大,达到了18.2%,黄鳍鲷和黑鲷的差异最小(2.4%)。两个序列已提交到GenBank数据库中,序列登录号为:DQ185608和DQ185609。

分类号： S917.4

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