芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 漆艳香

作者： 漆艳香;蒲金基;张欣;陆英;张贺;张辉强;谢艺贤

作者机构：

关键词： 芒果细菌性黑斑病菌;群体感应;XcmR;生物信息学

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2011 年 32 卷 04 期

页码： 92-96

收录情况： CSCD

摘要： 根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4 kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR。生物信息学分析表明,XcmR基因完整ORF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR/AsaR氨基酸序列具有86%~99%相似性。系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构。

分类号： S436.67

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