中国水禽新城疫病毒F和HN基因的变异趋势

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐怀英

作者： 徐怀英;秦卓明;王友令;欧阳文军;谭雷涛;何叶峰;金维江;袁小远

作者机构：

关键词： 新城疫病毒;F基因;HN基因;同源性;遗传变异;相关性

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2009 年 40 卷 03 期

页码： 394-401

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽NDV流行株,克隆其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,参考GenBank中具有F和HN核苷酸全长的16株国内外NDV代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有F基因的水禽毒株序列,参照传统F基因分型方法,分别对F和HN基因进行分型,同时进行相关比较、核苷酸和氨基酸同源性以及系统发育分析。结果表明:16株国内外代表株F和HN基因分型基本一致,但24株水禽NDV流行株中只有15株相同,符合率为62.5%,不同占37.5%(9/24)。系统发育和同源比较发现:水禽NDV流行株HN基因高度同源,同属Ⅶ型,而F基因则分属不同的基因型。通过对24株NDVF和HN基因氨基酸全长以及进行F基因分型的F基因47-420位核苷酸的同源性相关性比较证实:F基因前47-420位核苷酸的遗传变异与F基因氨基酸全长变异密切相关,r=0.916,但与HN基因的氨基酸变异不相关,显示出NDV在演变过程中F和HN基因具有相对的独立性。水禽NDV是家禽NDV的重要储存宿主,应高度重视水禽NDV的变异。

分类号： S852.659.5

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