藜麦EST-SSR的开发及通用性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张体付

作者： 张体付;戚维聪;顾闽峰;张晓林;李坦;赵涵

作者机构：

关键词： 藜麦;EST-SSR;分子标记;遗传关系;通用性

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2016 年 42 卷 04 期

页码： 492-500

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 藜麦因营养均衡受到越来越多的关注,但尚未深入开展其基础研究。开发微卫星序列重复SSR分子标记将为藜麦的遗传分析提供重要资源。本研究利用NCBI数据库中藜麦RNA测序RNA-Seq及表达序列标签EST数据挖掘、验证及评价藜麦EST-SSR,共发现1862个藜麦非单核苷酸EST-SSR。其中,二核苷酸重复最多(38.3%),六核苷酸重复最少(11.7%)。不同重复类型SSR的数量随着核苷酸数目的增加呈下降趋势。在随机选取验证的119个EST-SSR标记中,66(55.9%)个能够扩增出清晰条带,39个在4份藜麦资源中具有多态性,且其多态性与重复序列长度不具有显著相关性。t测验显示,多态性EST-SSR在藜麦与其他藜科种质间不存在显著差异,说明其具有良好的通用性,可用于藜科物种的遗传关系分析。

分类号： S519

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