基于基因组重测序技术开发特定地区黄鳝品系InDel标记

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李目岩

作者： 李目岩;赵一帆;黄伟伟;袁泉;杨航;张禹宁;李名友;吕巍巍;周文宗

作者机构：

关键词： 黄鳝;重测序;InDel标记;品系判别

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2025 年 41 卷 005 期

页码： 9-15

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黄鳝是我国重要的经济型淡水鱼类。以22个不同地理来源的255条野生黄鳝为样本，利用Illumina NovaSeq 6000平台开展全基因组重测序。结果表明：平均测序深度达5.52×，共获得了1 073.87 GB的高质量数据。通过对比基因组数据挖掘插入缺失（InDel）位点，结合引物设计与PCR验证，筛选出8对具有地域特异性的InDel分子标记，分别用于西南、两广与江西三大区域品系的分子鉴定。其中，西南地区4对标记条带差异为21～30 bp，两广地区2对标记条带差异为23～25 bp，江西地区2对标记条带差异为21～23 bp。电泳结果显示，这些标记具有良好的多态性、稳定性和实用性，可通过20～30 bp的条带差异（插入或缺失）实现不同地区黄鳝品系间的稳定判别。该研究可为黄鳝种质资源的区域鉴定、溯源管理和良种选育提供有力的技术支撑，为其他淡水鱼类基因组分型研究提供范例。

分类号： S917.4

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