白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 易丹

作者: 易丹;王博;段慧荣;李毅;王丽蓉

作者机构:

关键词: 14-3-3基因家族;白刺;生物信息学;表达模式

期刊名称: 草地学报

ISSN: 1007-0435

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 443-456

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探明白刺(Nitraria tangutorum)14-3-3基因家族的基本特征及其进化关系,本研究基于白刺转录组数据,利用生物信息学方法,对白刺14-3-3基因家族成员进行鉴定,预测其理化性质、亚细胞定位、保守结构域,分析其系统进化关系及其基因在不同浓度盐、干旱处理下的组织器官表达模式。结果表明:从白刺转录组数据中初步筛选出10个14-3-3家族成员,其中具有完整蛋白质编码区(Coding Sequence, CDS)的9个成员,其蛋白的编码氨基酸的数目为212~297个,等电点在4.73~6.14之间,分子量范围是24.06~33.51 kDa,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;表达模式分析表明,14-3-3基因在白刺不同组织器官中呈现不同的表达规律,且参与应答外界的干旱和盐胁迫。由此推测,14-3-3基因家族可能在白刺的胁迫防御方面发挥重要功能。本研究结果为进一步深入揭示白刺14-3-3基因家族的功能奠定基础。

分类号: S793.9

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