基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈微

作者： 陈微;潘美红;惠林冲;李威亚;郇国磊;何林玉;缪美华;陈振泰;杨海峰

作者机构：

关键词： 洋葱;bHLH;转录因子;生物信息学分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 11-18

收录情况： 北大核心

摘要： bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族，在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。本研究利用转录组数据对洋葱基因家族成员进行筛选和鉴定，并对家族成员进行理化性质、保守基序、亚细胞定位、系统发育和蛋白互作生物信息学分析，同时对bHLH基因家族在洋葱幼苗中的表达情况进行分析。结果表明，从洋葱转录组共鉴定到36个bHLH基因，预测编码蛋白质含有的氨基酸数量为127～610个，且均为亲水性蛋白，系统发育分析表明，洋葱bHLH基因家族分为12个亚族，同一亚族的大多数基因具有相似的保守基序，大多数bHLH基因在洋葱幼苗中表达，不同基因的表达量水平差异较大。本研究结果为进一步研究洋葱bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础。

分类号： S633.2

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