基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王涛

作者： 王涛;扈艳萍;朱华;张子君;邹庆道

作者机构：

关键词： 番茄;遗传多样性;SNP;SSR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 015 期

页码： 5143-5149

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析不同番茄种质的遗传多样性,利用120个SNP和29个SSR标记对210份番茄自交系进行基因分型.结果表明,SSR具有较高的多态性,而SNP检测到更高的基因多样性.在预先划分的3个亚群中,樱桃番茄遗传变异最高,常规番茄品种次之,现代番茄品系最低,说明早期育成的番茄品种仍具有较为丰富的遗传多样性.群体结构分析发现,SNP可将3个亚群区分开,同时常规番茄进一步分为粉果番茄和红果番茄2个小亚群.SSR的分析结果与SNP和预先的分类并不一致,未能将常规番茄和现代品系完全区分开.遗传距离分析显示,SNP具有更高的分辨率,可以区分所有供试材料,有6对材料组合未被SSR数据区分开.总的来说,在栽培番茄遗传多样性分析中,SNP标记具有更高的效率.

分类号： S641.2

  • 相关文献

[1]新疆本地梨品种的遗传多样性及亲缘关系. 毕清芮,崔东升,马新院,薛玉冉,章世奎,樊国全,牛莹莹. 2025

[2]番茄SSR遗传多样性及其品质性状的关联分析. 王苓,江卫,叶仕伦. 2017

[3]我国75份小麦品种SNP和SSR指纹图谱构建与比较分析. 刘丽华,刘阳娜,张明明,李宏博,庞斌双,赵昌平. 2020

[4]花生杂种分子鉴定和ahFAD2基因分型技术研究进展. 袁美,王传堂,韩锁义,任艳,尹亮,石延茂,徐平,王效华,李双铃,郑奕雄. 2017

[5]我国玉米品种标准DNA指纹库构建研究及应用进展. 赵久然,王凤格,易红梅,田红丽,杨扬. 2015

[6]绒毛状烟草和林烟草全长cDNA文库构建及EST序列分析. 孙榕,陈明丽,解敏敏,孙玉合,龚达平. 2018

[7]基于RAD-seq的西番莲系统进化分析及种间SSR标记开发. 田青兰,刘洁云,黄伟华,夏秀忠,杨行海,覃柳燕,张英俊,牟海飞,吴艳艳. 2022

[8]基于李府贡枣转录组测序的SSR和SNP特征分析. 周军永,陆丽娟,刘茂,朱淑芳,仇鹏辉,孙其宝. 2019

[9]贵州省主要栽培茶树品种指纹图谱构建与遗传结构分析. 乔大河,郭燕,杨春,李燕,陈娟,陈正武. 2019

[10]农作物品种DNA指纹库构建研究进展. 王凤格,赵久然,田红丽,杨扬,易红梅. 2015

[11]吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用. 张茗起,王蕊,张春宵,孙擘,任洁,李淑芳,王璐,朱少喜,张江斌,施昕晨,王海杰,张云龙,田红丽,赵怡锟,匡猛,王元东,易红梅,李晓辉,王凤格. 2024

[12]基于转录组序列的火龙果SSR和SNP多态性分析. 严佳文,肖图舰,袁启凤,解璞,彭志军,毛永亚,马玉华. 2018

[13]SSR和SNP标记在玉米分子标记辅助背景选择中的应用比较. 宋伟,赵久然,王凤格,田红丽,葛建镕,王元东,赵衍鑫. 2016

[14]抗白粉病基因PmCH1302的遗传分析及染色体定位. 张晓军,马原丽,郭慧娟,张小辉,乔麟轶,李欣,詹海仙,畅志坚. 2017

[15]基于转录组测序的中华鳖SSR和SNP特征分析及性别标记筛选. 雷骆,祝骏贤,陈辰,王亚坤,刘晓莉,洪孝友,于凌云,魏成清,李伟,朱新平. 2023

[16]基于人参果转录组测序的SSR和SNP特征分析. 陈姝欣,朱浩东,杨梦思,陶连德,钟启文,杨世鹏. 2020

[17]基于转录组测序的椰心叶甲啮小蜂SSR、SNP和InDel位点分析. 刘华伟,李朝绪,李芬,吕朝军,吴少英,覃伟权. 2021

[18]DNA分子标记在月季中的应用. 邱显钦,鄢波,唐开学,张颢,李树发. 2006

[19]SSR和SNP两种标记技术在玉米品种真实性鉴定中的比较分析. 李雪,田红丽,王凤格,赵久然,李云伏. 2014

[20]番茄Mi-1基因的SNP分型. 李亚玲,李景富,康立功,张贺,董晓慧,许向阳. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序