口蹄疫病毒株AF72VP2的结构模拟与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈启伟

作者： 陈启伟;王永录;张永光;潘丽;方玉珍;刘力宽;蒋守田;吕建亮;周鹏;张中旺;张昱;张淑刚;杜进鑫;李正丰;王刚

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;VP2结构蛋白;3D结构;B细胞表位

期刊名称： 华北农学报

ISSN：

年卷期： 2009 年 04 期

页码： 64-69

收录情况： CSCD

摘要： 为了分析FMDVAF72VP2蛋白结构和功能的关系。以口蹄疫病毒株AF72RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-Teasy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和SpeⅠ、SphⅠ双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72VP2的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72VP2结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72VP2结构蛋白的B细胞抗原表位。分析表明,口蹄疫病毒VP1,VP2,VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P>0.05);而他们在氨基酸水平上的变异率差异显...

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