利用转录组技术鉴定影响硒都黑猪肌内脂肪含量性状关键基因及标记的研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴俊静

作者： 吴俊静;田海斌;刘晓哲;乔木;周佳伟;孙华;彭先文;梅书棋

作者机构：

关键词： 硒都黑猪;肌内脂肪含量;ADIG基因;SNP;RNA-seq

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2023 年 59 卷 012 期

页码： 186-191

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 肌内脂肪含量(IMF)是肉质性状的一项重要指标,挖掘影响IMF性状的关键基因、筛选功能分子标记对肉质性状的遗传改良具有重要意义.本研究利用普通转录组技术分析了IMF存在显著差异的 6 个硒都黑猪背最长肌样本,筛选获得了 78 个差异表达基因(|log2FC|>1,Q value<0.05),主要富集于脂肪细胞分解调节、脂肪消化吸收、碳水化合物消化吸收、胆固醇代谢、甘油酯代谢、PPAR、ErbB等信号通路.利用qPCR技术验证了其中一个差异表达基因ADIG,发现其在高IMF组背最长肌组织中表达量显著高于低IMF组,与测序结果一致.接着在硒都黑猪群体中,利用混合DNA样本池PCR测序法筛选鉴定出猪ADIG基因g.202 G>A、g.16433 G>A、g.16608 G>A等 3 个SNP位点,经关联分析发现这 3 个SNP位点均显著影响IMF性状.综上,本研究发现了硒都黑猪IMF性状显著相关SNP位点 3 个,为其肉质性状的遗传改良提供了新的分子育种标记.

分类号： S828.2

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