美洲南瓜α-微管蛋白CpTUA基因的分离及其作为内参基因的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱海生

作者： 朱海生;刘建汀;温文旭;叶新如;王彬;李永平;陈敏氡;林珲;温庆放

作者机构：

关键词： 美洲南瓜;内参基因;α-微管蛋白;表达分析

期刊名称： 中国细胞生物学学报

ISSN： 1674-7666

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 2040-2050

收录情况： CSCD

摘要： 为了获得美洲南瓜α-tubulin基因,并设计合适的荧光定量PCR内参引物,该研究通过转录组测序和RT-PCR方法获得了1条长达1 863 bp的c DNA,命名为CpTUA, GeneBank登录号为:MH310440。生物信息学分析表明,该序列包含1个开放读码框(open reading frame, ORF),大小为1353 bp,预测共编码450个氨基酸,理论分子大小约为49.57 kDa,蛋白质等电点为4.84。Motif Scan分析显示, CpTUA蛋白质的氨基酸序列49―246位和248―393位分别为Tubulin和Tubulin-C保守区域。同源性分析表明,基因编码的蛋白质与同为南瓜属的中国南瓜和印度南瓜同源蛋白的相似性达到99%,具有高度的保守性。在此基础上,设计了1对的荧光定量PCR引物,该引物具有较高的特异性和重复性。RT-PCR和qRT-PCR分析表明, CpTUA基因在美洲南瓜不同组织和不同胁迫处理下均能稳定表达,适合在美洲南瓜基因表达研究中作为内参基因。该研究为开展美洲南瓜重要功能基因的表达模式和调控机制的研究奠定基础。

分类号： S642.1

  • 相关文献

[1]巴西橡胶树α-微管蛋白HbTUA2基因的克隆、表达及生物信息学分析. 杨洪,邓治,刘辉,代龙军,李德军. 2017

[2]枣树内参基因ZjH3的克隆与筛选. 孟玉平,曹秋芬,孙海峰. 2010

[3]花椰菜BobACT基因的克隆及其作为内参基因的研究. 林珲,朱海生,温庆放,黄丽芳. 2019

[4]印度南瓜延伸因子基因CmEF1a的克隆与分析. 朱海生,刘建汀,温文旭,李永平,王彬,陈敏氡,温庆放. 2019

[5]牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin的克隆及其作为内参基因的研究. 刘传娇,王顺利,薛璟祺,朱富勇,任秀霞,李名扬,张秀新. 2015

[6]火龙果溃疡病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 姚姿婷,曹雪颖,肖雪,李瑞芳,韦小妹,邹承武,朱桂宁. 2023

[7]百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析. 梁云,袁素霞,冯慧颖,徐雷锋,袁迎迎,刘春,明军. 2013

[8]西葫芦CpActin内参基因的分离及其作为内参基因的初步应用. 刘建汀,朱海生,王彬,李永平,陈敏氡,张前荣,温庆放. 2019

[9]金线莲3个持家基因表达稳定性分析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2018

[10]花生黄曲霉抗性与SR和α-微管蛋白相关性. 严海燕,宗成志,翟刚,马生财,单世华. 2012

[11]南瓜属4个种及种间杂种耐热性比较. 智海英,岳青,陈敏克,马海龙. 2020

[12]南瓜属黄色果皮性状的种间转育及遗传分析. 马海龙,智海英,岳青. 2020

[13]美洲南瓜SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选. 邹伶威,李柱刚,韩俊岩,王珣. 2013

[14]美洲南瓜远缘杂交亲和性研究. 智海英,马海龙,韩红艳,范三红. 2006

[15]美洲南瓜转录组SSR信息分析及其分子标记开发. 朱海生,黄丽芳,王彬,刘建汀,叶新如,陈敏氡,张前荣,林珲,李永平,温庆放. 2018

[16]黑籽南瓜种间杂交研究. 马海龙,智海英,岳青. 2011

[17]籽用美洲南瓜新品种“金龙瓜1号”的选育. 韩俊岩,李柱刚,王珣,李晓娟. 2018

[18]中国南瓜无蔓性状种间遗传研究. 马海龙,智海英,岳青,梁燕平,苗如意. 2011

[19]灰毡毛忍冬内参基因筛选和Mads-box家族基因AGL15的时空表达分析. 朱贻霖,谢舒平,陈林,欧阳琳,刘峰,张亚丽,刘湘丹,童巧珍. 2016

[20]湖羊小肠黏膜内参基因筛选. 马志远,翁秀秀,李飞,李发弟,王维民,刘婷. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序