多年宿根甘蔗的转录组分析及差异基因挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程琴

作者： 程琴;李佳慧;谭秦亮;宋奇琦;朱鹏锦;欧克纬;农泽梅;卢业飞;吕平;周全光;庞新华;彭欣怡

作者机构：

关键词： 甘蔗;宿根性;转录组;脱落酸

期刊名称： 中国生物工程杂志

ISSN： 1671-8135

年卷期： 2024 年 0Z1 期

页码： 25-38

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甘蔗（Saccharum hybirds）宿根性直接关系到甘蔗生产成本和种植效益，品种、环境和栽培措施均会影响甘蔗宿根能力，但品种的种性是影响宿根性最关键因素。国内外从分子生物学层面解释甘蔗宿根性差异的文献鲜见报道，从转录水平分析不同宿根年限GR2号和ROC22号基因表达的差异。结果表明：转录组测序共得到100 558条转录本和25 582条Unigene。获得53 790条Unigene的注释结果，分别在NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO和Pfam数据库进行比对。GO功能注释共分成三大类，51小类，6年宿根蔗注释到1 029个差异基因，3年宿根蔗注释到3 391个差异基因。主要KEGG代谢通路有8条，分别涉及植物激素信号转导，淀粉和蔗糖代谢，甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢，苯丙素生物合成，同源重组，DNA复制，错配修复及植物病原体相互作用。筛选出脱落酸（ABA）相关差异基因6个，分别为脱落酸不敏感蛋白2基因（ABI2）、bZIP转录因子超家族蛋白、碱性亮氨酸拉链型转录因子基因（ABI5）、aba响应元件结合因子1基因（ABF1）、G-box结合因子基因（GBFs）、aba响应元件结合因子基因（ABF）。以上差异基因将作为后期进行基因表达和功能分析的参考基因，并联合蛋白质组学深入分析影响甘蔗宿根性的分子机制。

分类号： S566.1

  • 相关文献

[1]不同宿根性甘蔗品种根际土壤微生物学特性分析. 农泽梅,欧克纬,卢业飞,周全光,吕平,庞新华,朱鹏锦,宋奇琦,李佳慧,谭秦亮,程琴. 2024

[2]河池市蔗区主栽甘蔗品种的生产表现. 韦素,刘振华,韦良炬,王宇萍. 2022

[3]桂糖55号的宿根性及不同种植密度对其农艺性状的影响. 贤武,邓宇驰,经艳,黄海荣,谭芳,王伦旺. 2022

[4]高产高糖强宿根性甘蔗新品种桂热2号的选育. 吕平,周全光,王友富,庞新华,黄强,朱鹏锦,农泽梅,谭秦亮,欧克纬,卢业飞,程琴,宋奇琦,李佳慧. 2024

[5]不同宿根年限甘蔗品种内源激素及酶活性分析. 程琴,谭秦亮,李佳慧,朱鹏锦,周全光,欧克纬,卢业飞,吕平,庞新华. 2022

[6]甘蔗宿根萌发期內源激素变化与其宿根性的关系. 覃伟,吴才文,姚丽,陈学宽,赵培方,曾千春. 2014

[7]用新台糖甘蔗品种作亲本培育强宿根后代的潜力评价. 覃伟,吴才文,杨昆,赵培方,赵俊,刘家勇,姚丽,昝逢刚,夏红明. 2015

[8]广西南宁蔗区2021年甘蔗生产情况调研报告. 邓宇驰,周忠凤,罗霆,王宇萍,周慧文,刘晓婷,樊保宁,覃振强,李德伟,黄赞斌,刘志平,王伦旺,吴建明. 2021

[9]桂糖44号在桂中蔗区的适应性分析. 陈家福,张晋,韦开军,冯斌,杨祖丽,李燕娇,王春玲,钟德发,王宇萍,邓宇驰. 2023

[10]甘蔗家系宿根性分析. 杨荣仲,周会,梁强,唐仕云,王伦旺,桂意云,黄海荣,黄赞斌,贤武,雷敬超. 2021

[11]甘蔗宿根性研究 I.甘蔗宿根蔗蔸形态特征与其宿根性的关系. 覃伟,吴才文,赵俊,赵培方,杨昆,陈学宽,姚丽,曾千春. 2017

[12]用新台糖甘蔗品种作父本培育强宿根后代的潜力评价. 覃伟,吴才文,赵培方,赵俊,刘家勇,杨昆,姚丽,昝逢刚,夏红明. 2014

[13]崇左市甘蔗主要品种应用现状分析与建议. 赖振光,吴建明,凌中华,王伦旺,张胜忠,刘晓婷,张华伟,邓宇驰. 2024

[14]甘蔗宿根性研究Ⅰ.甘蔗宿根蔗蔸形态特征与其宿根性的关系. 覃伟,吴才文,赵俊,赵培方,杨昆,陈学宽,姚丽,曾千春. 2017

[15]强宿根性甘蔗新品种中糖1号的选育. 甘仪梅,杨本鹏,武媛丽,曾军,曹峥英,彭李顺,蔡文伟,张树珍. 2020

[16]甘蔗新品种桂糖54号的选育. 王伦旺,杨荣仲,王宇萍,黄赞斌,唐仕云,经艳,黄海荣,贤武,邓宇驰. 2021

[17]甘蔗宿根关键性状及其在宿根性快速评价中的应用. 覃伟,张保青,黄玉新,周珊,赵丽萍,李纯佳,李旭娟,张静,李傲梅,任生林,黄东亮,刘新龙. 2024

[18]用新台糖甘蔗品种作母本培育强宿根后代的潜力评价. 覃伟,吴才文,曾千春,赵俊,赵培方,刘家勇,杨昆,夏红明,姚丽,昝逢刚. 2012

[19]甘蔗宿根性研究Ⅱ.甘蔗种性宿根影响因子与其宿根性的关系. 覃伟,吴才文,赵俊,姚丽,陈学宽,杨昆,曾千春. 2017

[20]基于Label-free技术的甘蔗宿根性蛋白质组学分析. 宋奇琦,程琴,周全光,庞新华,李佳慧,谭秦亮,朱鹏锦,卢业飞,农泽梅,吕平,欧克纬. 2025

作者其他论文 更多>>

微信小程序