不同触手数目的海蜇螅状体比较转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 田梅琳
作者: 田梅琳;李云峰;李玉龙;鲍相渤;刘卫东;陈百灵;周遵春
作者机构:
关键词: 海蜇;螅状体;触手;转录组;差异表达基因
期刊名称: 水产学杂志
ISSN: 1005-3832
年卷期: 2025 年 38 卷 002 期
页码: 13-20
摘要: 海蜇(Rhopilema esculentum)是我国重要的海洋经济动物,具有独特的生活史,其中无性繁殖螅状体阶段持续时间最长,约占整个生活史周期的60%,是海蜇生长发育的关键阶段。本研究利用Illumina HiSeq测序技术对具有16条、20条和24条触手的螅状体进行转录组测序,共获得789.23 Mreads,拼接得到116 501条unigenes,检测到超过1.1 M SNP位点、4 858个SSR位点和2 580个差异表达标签(DEGs)。差异表达基因KEGG富集结果表明,螅状体触手数目与蛋白质、葡萄糖、丙氨酸、甘氨酸和苏氨酸等多个氨基酸代谢通路相关,且触手数目越多的螅状体代谢水平越高。显著差异表达基因分析显示,表皮生长因子(egfr)、RNA结合基序蛋白、rbm46基因、蛋白磷酸酶2A(pp2a)、T-box基因、新生多态相关复合体α(naca)和hox基因随着触手数目的增加上调表达;细胞色素P450和超氧化物歧化酶1(sod1)基因下调表达。本实验结果可为螅状体触手数目分化个体的生长发育及差异形成相关基因的挖掘与功能研究提供基础信息,也为海蜇无性繁殖阶段人工选育提供重要参考。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]海蜇四触手螅状体两种发生方式的观察. 刘春胜,庄志猛,陈四清,燕敬平,刘长琳,刘顶海,张树森,宋建强. 2011
[2]生活史不同阶段的海月水母(Aurelia sp.1)与海蜇(Rhopilema esculenta)的相互捕食关系. 李宗飞,刘春胜,庄志猛,邹安革,陈四清,燕敬平,刘长琳. 2012
[3]海蜇摄食生态学研究进展. 李玉龙,高祥刚,鲍相渤,付杰,李轶平,苏浩,孙明,李云峰. 2022
[4]春季升温控制对海蜇横裂生殖的影响. 段妍,孙明,陈福迪,王一彤. 2023
[5]海蜇(Rhopilema esculenta)浮浪幼虫及早期螅状体摄食行为的研究. 刘春胜,邹安革,庄志猛,陈四清,王相杰,王绍军,燕敬平,李旭,刘长琳. 2012
[6]吲哚美辛诱导海蜇螅状体横裂生殖的分子信号调控机制. 谭树亮,米铁柱,甄毓,于志刚. 2017
[7]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018
[8]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014
[9]福清山羊和戴云山羊夏季发情期卵巢组织比较转录组分析. 吴贤锋,李文杨,刘远,张莹,黄勤楼. 2019
[10]外源赤霉素诱导矮生山茶恨天高植株生长的转录组分析. 王江英,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,葛金涛,赵统利,李纪元,惠林冲,邵小斌. 2020
[11]玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,张少平,林碧珍,洪建基. 2020
[12]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020
[13]感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析. 刘玉娣,王香萍,侯茂林. 2018
[14]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019
[15]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019
[16]红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释. 吴亚维,徐娟,韩秀梅,张兴无,洪怡,文晓鹏. 2019
[17]硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析. 姚运法,练冬梅,林碧珍,赖正锋,洪建基. 2021
[18]亚麻响应低钾胁迫转录谱分析. 黄文功,姜卫东,姚玉波,宋喜霞,刘岩,陈思,赵东升,吴广文,袁红梅,任传英,孙中义,吴建忠,康庆华. 2021
[19]低温胁迫对冰菜转录组水平响应分析. 赖正锋,姚运法,林碧珍,练冬梅,洪建基. 2021
[20]卡尼鄂拉蜂越冬工蜂咽下腺转录组学分析. 范荣莉,王康,蔺哲广,张文文,刘振国,梁勤,陈国宏,吉挺. 2020
作者其他论文 更多>>
-
三峡库区夏季和秋季鱼类群落结构及环境影响因子研究
作者:吴凡;李云峰;马宝珊;张燕;茹辉军;沈子伟;魏念
关键词:三峡库区;鱼类群落结构;优势种;环境因子
-
晚熟梨新品种‘美香’
作者:李振江;李云峰;贾艳利;李小虎;申晓峰;王永博
关键词:梨;晚熟;品种
-
海参皂苷结构特征及其生物活性和作用机制研究进展
作者:刘煜珺;郑杰;刘东竹;于笛;李龙;傅志宇;刘桂英;周遵春
关键词:海参皂苷;结构特征;生物活性;作用机制
-
我国科研事业单位成本核算方法研究现状
作者:李云峰;丁志敏;高正
关键词:科研事业单位;成本核算;研究文献分析
-
基于虾夷扇贝自交家系的双列杂交配合力分析
作者:赵亮;高杉;蒋经伟;周遵春
关键词:虾夷扇贝;双列杂交;一般配合力;特殊配合力;自交
-
长江中上游重要渔业水域环境质量评估
作者:吴凡;魏念;高立方;张燕;茹辉军;吴湘香;倪朝辉;李云峰
关键词:长江中上游;重要渔业水域;水质指数法;WQImin模型;水质评价
-
财政资金投入对乡村振兴的影响及优化策略
作者:李云峰;麻志宏
关键词:乡村振兴;财政资金;投入