扩展莫尼茨绦虫基因芯片的制作及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张慧
作者: 张慧;赵文娟;薄新文;王新华;李娜
作者机构:
关键词: 扩展莫尼茨绦虫;基因芯片;CDNA
期刊名称: 寄生虫与医学昆虫学报
ISSN: 1005-0507
年卷期: 2010 年 017 卷 001 期
页码: 6-9
摘要: 通过EST计划获得1 080个基因片段,制备了扩展莫尼茨绦虫cDNA芯片.该芯片一个域有52行、78列,密度为863点/cm2,其中包含1 080个靶基因、9个阳性对照、16个阴性对照、8个空白对照,每个基因做3个重复.用扩展莫尼茨绦虫的成节与头颈节总RNA与芯片进行杂交,获得了成节与头颈节基因表达谱,芯片结果分析差异系数为0.1807,共找到91个在扩展莫尼茨绦虫成节高表达基因,幼节高表达基因81个,其他的基因表达差异不大.通过同源性比对分析,成节高表达基因主要有钙调节蛋白、外致密纤维精子尾、富含半胱氨酸蛋白前体和卵黄蛋白原等;头颈节高表达基因主要有果糖-二磷酸盐醛缩酶、皮层细胞蛋白和胶原等.该芯片可以进一步应用于扩展莫尼茨绦虫基因组等方面的研究,对基因表达差异进行高通量检测.
分类号: R5
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